乳腺癌与良性组织RNA差异表达数据集
该数据集来自NCBI，包含乳腺癌原发癌组织与配对癌旁非癌组织的全基因组微阵列表达谱，用于发现两者之间差异表达的RNA。数据以GSE112848系列矩阵文件形式提供，覆盖人类样本，可用于识别与乳腺癌进展相关的关键基因，并支持乳腺癌与良性组织的分类或差异表达分析研究（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
乳腺癌与良性组织RNA差异表达数据集
GSE112848 数据集来自 NCBI，主题为乳腺癌与良性组织之间差异表达的 RNA。该数据集通过全基因组微阵列表达谱，对乳腺癌原发癌组织与配对癌旁非癌组织进行比较，旨在发现两者之间差异表达的 RNA，并识别在乳腺癌进展中可能发挥关键作用的相关基因。数据集以 GSE112848 系列矩阵文件形式提供，文件数量为 1，覆盖人类样本，可用于乳腺癌与良性组织的分类或差异表达分析研究。
【数据集背景】
乳腺癌是常见的恶性肿瘤之一，探索乳腺癌组织与良性组织在基因表达层面的差异，有助于理解疾病发生发展的分子基础。该数据集正是围绕这一目标构建：通过全基因组微阵列表达谱，比较乳腺癌原发癌组织与配对癌旁非癌组织之间的 RNA 表达差异，为识别与乳腺癌进展相关的关键基因提供数据基础。数据集标题明确指向“乳腺癌与良性组织之间差异表达的 RNA”，其研究定位属于肿瘤尤其是乳腺癌方向的表达谱分析。
【数据内容】
该数据集的核心内容是乳腺癌原发癌组织与配对癌旁非癌组织的全基因组微阵列表达谱。数据以 GSE112848 系列矩阵文件形式提供，文件样例为 GSE112848_series_matrix.txt.gz，文件数量为 1。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL16956 和 9606，表明数据基于微阵列表达谱平台，涉及人类样本。数据集可用于发现乳腺癌与良性组织之间差异表达的 RNA，并支持后续的分类或差异表达分析研究。
【采集与来源】
数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 Xiaoqu，Hu，发布时间为 Apr 09 201。根据源站描述，为寻找乳腺癌与良性组织之间差异表达的 RNA，研究采用全基因组微阵列表达谱作为发现平台，以识别在乳腺癌进展中发挥关键作用的基因。原发癌组织与配对癌旁非癌组织在切除后立即于液氮中速冻，并用于全基因组表达分析。上述信息说明了样本采集与实验设计的基本来源背景。
【适用场景】
该数据集适用于乳腺癌与良性组织之间的差异表达分析，可用于识别两者之间表达存在差异的 RNA，并进一步筛选可能与乳腺癌进展相关的关键基因。由于数据覆盖人类样本并采用微阵列表达谱，亦可支持乳腺癌与良性组织的分类研究，以及围绕差异表达结果开展的后续分析。其主题标签中的 Expression profiling by array 与 GPL16956 也提示该数据适合在微阵列表达谱框架下使用。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE112848_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包格式。读取时应按文件格式进行解析，建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于文件数量为 1，数据接入相对集中，但仍需注意压缩包解压与矩阵文件解析的规范性，以确保后续差异表达分析或分类分析的输入数据准确可靠。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本数量、平台细节、批次效应或缺失值处理等方面的具体说明。该数据集文件数量为 1，使用时应以实际文件内容为准，并在分析前核对字段与编码。由于源站描述主要围绕研究目的与样本处理方式，未提供更详细的质控指标或验证结果，相关质量评估需结合数据文件本身进行。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。使用时如需引用，应参考 NCBI 源站的相关说明；许可条件亦以源站未提供为准，建议在使用前查阅源站页面获取准确信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE112848
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为寻找乳腺癌与良性组织间差异表达的RNA，我们采用全基因组微阵列表达谱分析作为发现平台，以识别在乳腺癌进展中起关键作用的基因。原发癌组织及配对的癌旁非癌组织在切除后立即于液氮中速冻，并用于进行基因组表达分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
