全基因组孕激素受体结合：子宫肌瘤与乳腺癌中的细胞类型特异性及共享机制（染色质免疫沉淀测序）
本研究以ChIP-seq鉴定经RU486（孕激素拮抗剂）处理的人乳腺癌T47D细胞与原代子宫平滑肌瘤细胞中的PR相互作用位点，分析RU486调控的基因
基本信息
资源简介
全基因组孕激素受体结合：子宫肌瘤与乳腺癌中的细胞类型特异性及共享机制（染色质免疫沉淀测序）
该数据集英文名为 Genome-Wide Progesterone Receptor Binding: Cell Type-Specific and Shared Mechanisms in Uterine Fibroids and Breast Cancer (ChIP-Seq)，在站内归入肿瘤 / 乳腺癌类别，关联主题为 Genomics，来源站为 omicsdi.org。研究以 ChIP-seq 鉴定经 RU486（孕激素拮抗剂）处理的人乳腺癌 T47D 细胞与原代子宫平滑肌瘤细胞中的 PR 相互作用位点，并分析 RU486 调控的基因，关注子宫肌瘤与乳腺癌中细胞类型特异性及共享的调控机制。
【数据集背景】
该数据集聚焦于子宫肌瘤与乳腺癌中孕激素受体（PR）结合的全基因组特征，以及细胞类型特异性与共享机制。来源站介绍，其分析对象是 RU486（一种孕激素拮抗剂）调控的基因，涉及人乳腺癌 T47D 细胞与人子宫平滑肌瘤平滑肌细胞。研究假设是 RU486 通过失活多个基因的转录来抑制肿瘤生长，这些基因会触发关键信号通路，从而在乳腺癌和子宫肌瘤中诱导肿瘤发生。组织特异性和共同的基因调控模式可能决定抗孕激素药物在子宫肌瘤与乳腺癌中的治疗效果。该数据集关联的主题为 Genomics，在站内归入肿瘤 / 乳腺癌类别。
【数据内容】
来源站介绍，研究应用 ChIP-seq 来鉴定经 RU486 处理的 T47D 乳腺癌细胞与原代子宫平滑肌瘤细胞中的 PR 相互作用位点。其数据内容围绕 RU486 调控基因的分析展开，关注 PR 相互作用位点的全基因组定位，以及乳腺癌细胞与子宫肌瘤细胞之间细胞类型特异性和共享的调控机制。数据集英文名称为 Genome-Wide Progesterone Receptor Binding: Cell Type-Specific and Shared Mechanisms in Uterine Fibroids and Breast Cancer (ChIP-Seq)。其关联主题为 Genomics。除上述内容外，关于具体样本数量、测序深度、数据文件类型、基因组版本、峰值列表或原始读长等更细的数据字段与文件信息，源站未提供。
【采集与来源】
来源站为 omicsdi.org。来源站介绍，研究对象包括人乳腺癌 T47D 细胞和人子宫平滑肌瘤平滑肌细胞，并在 RU486 处理条件下开展分析；ChIP-seq 用于识别 T47D 乳腺癌细胞与原代子宫平滑肌瘤细胞中的 PR 相互作用位点。除上述内容外，关于采集过程与数据处理流程的更多信息，源站未提供。
【适用场景】
根据来源站介绍，该数据集可用于关注 RU486 调控基因、PR 相互作用位点，以及子宫肌瘤与乳腺癌中组织特异性与共享基因调控模式的研究。其研究假设涉及 RU486 通过失活多个基因转录来抑制肿瘤生长，并可能帮助理解抗孕激素药物在子宫肌瘤和乳腺癌中的治疗效应。由于其在站内归入肿瘤 / 乳腺癌类别，关联主题为 Genomics，该数据集适合归入肿瘤学与基因组学相关分析场景。关于其他具体应用场景、分析流程或临床用途，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-40724
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
分析RU486（一种孕激素拮抗剂）在人乳腺癌T47D细胞和人子宫平滑肌瘤平滑肌细胞中调控的基因。假说认为，RU486通过使多个基因的转录失活来抑制肿瘤生长，这些基因可触发关键信号通路，从而在乳腺癌和子宫平滑肌瘤中诱导肿瘤发生。组织特异性和共同的基因调控模式可能决定抗孕激素药物在子宫平滑肌瘤和乳腺癌中的治疗效果。我们应用ChIP-seq鉴定经RU486处理的T47D乳腺癌细胞和原代子宫平滑肌瘤细胞中的PR相互作用位点。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
