雌二醇与endoxifen在MCF7亲本及表达ER-beta乳腺癌细胞中引发的基因表达谱

该数据可用于比较estradiol与endoxifen在不同ER状态乳腺癌细胞中引发的全局基因表达差异,探索estrogen receptor beta在endoxifen作用中的相关性(来源 omicsdi.org)

omicsdi
浏览 10
基因组分类Transcriptomics
Gene expression profiles elicited by estradiol and endoxifen in MCF7 parental and ER-beta expressing breast cancer cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

雌二醇与endoxifen在MCF7亲本及表达ER-beta乳腺癌细胞中引发的基因表达谱

该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/乳腺癌领域,主题为Transcriptomics。数据为MCF7亲本细胞(仅表达estrogen receptor alpha)与稳定表达estrogen receptor beta的MCF7细胞在乙醇对照、1nM 17-beta-estradiol或1nM estradiol加40nM endoxifen处理24小时后的全基因表达谱,所有研究均设2个生物学重复。该数据可用于比较estradiol与endoxifen在不同ER状态乳腺癌细胞中引发的全局基因表达差异,探索estrogen receptor beta在endoxifen作用中的相关性(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们此前已证明,endoxifen是负责在表达estrogen receptor-alpha的乳腺癌细胞中引发该药物抗雌激素效应的最重要tamoxifen代谢物。然而,estrogen receptor-beta在介导endoxifen作用中的相关性尚未被探索。因此,本研究的目的是确定在亲本MCF7乳腺癌细胞(仅表达estrogen receptor alpha)与稳定表达estrogen receptor beta的MCF7细胞之间,estradiol处理和endoxifen所引发的全局基因表达谱差异。在分别用乙醇溶剂、1nM 17-beta-estradiol或1nM estradiol加40nM endoxifen处理24小时后,从亲本或表达estrogen-receptor beta的MCF7细胞中分离总RNA。所有研究均以2个生物学重复进行。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-27375

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-27375

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们之前已证明,endoxifen是负责在表达雌激素受体α的乳腺癌细胞中引发他莫昔芬抗雌激素效应的最重要代谢物。然而,雌激素受体β在介导endoxifen作用中的相关性尚未被探索。因此,本研究的目标是确定在亲代MCF7乳腺癌细胞(仅表达雌激素受体α)与稳定表达雌激素受体β的MCF7细胞之间,由雌二醇处理和endoxifen引发的全局基因表达谱差异。在分别用乙醇载体、1nM 17-β-雌二醇或1nM雌二醇加40nM endoxifen处理24小时后,从亲代或表达雌激素受体β的MCF7细胞中分离总RNA。所有研究均进行了2次生物学重复。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。