乳腺癌干细胞模型的基因表达变化
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦乳腺癌干细胞模型的转录组研究。研究利用 PMA 诱导 PKC 使上皮细胞系 MCF7 发生上皮间质转化（EMT），所得细胞中 5-10% 具有癌症干细胞（CSC）表型
基本信息
资源简介
乳腺癌干细胞模型的基因表达变化
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦乳腺癌干细胞模型的转录组研究。研究利用 PMA 诱导 PKC 使上皮细胞系 MCF7 发生上皮间质转化（EMT），所得细胞中 5-10% 具有癌症干细胞（CSC）表型。数据覆盖这些 CSC 表型细胞与非 CSC 表型细胞的转录组差异，可用于分析 EMT 相关基因表达变化、探索乳腺癌干细胞特征及治疗抵抗与复发机制（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：上皮间质转化（EMT）在癌症侵袭和转移过程中被激活，富集癌症干细胞（CSC），并导致治疗抵抗和疾病复发。上皮细胞系 MCF7 可通过 PMA 诱导 PKC 而发生 EMT。所得细胞中 5-10% 具有 CSC 表型。本研究考察这些细胞的转录组及其与非 CSC 表型细胞的差异。上皮间质转化（EMT）在癌症侵袭和转移过程中被激活，富集癌症干细胞（CSC），并导致治疗抵抗和疾病复发。上皮细胞系 MCF7 可通过 PMA 诱导 PKC 而发生 EMT。所得细胞中 5-10% 具有 CSC 表型。本研究考察这些细胞的转录组及其与非 CSC 表型细胞的差异。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-53266
下载信息
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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-53266
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
上皮-间质转化（EMT）在癌症侵袭和转移过程中被激活，可富集癌症干细胞（CSCs），并导致治疗耐药和疾病复发。上皮细胞系MCF7可通过PMA诱导PKC而发生EMT。所得细胞中5-10%具有CSC表型。本研究探讨这些细胞的转录组及其与非CSC表型细胞的差异。上皮-间质转化（EMT）在癌症侵袭和转移过程中被激活，可富集癌症干细胞（CSCs），并导致治疗耐药和疾病复发。上皮细胞系MCF7可通过PMA诱导PKC而发生EMT。所得细胞中5-10%具有CSC表型。本研究探讨这些细胞的转录组及其与非CSC表型细胞的差异。用PMA刺激MCF7细胞并进行FACS分选。4个样本，无重复。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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