GDC HCMI-CMDC:人类癌症模型倡议的NCI癌症模型开发

该数据集来自GDC的HCMI-CMDC项目,即人类癌症模型倡议的NCI癌症模型开发,属于肿瘤/乳腺癌分类。原发部位涵盖舌其他及未特指部位、胃、支气管和肺、喉、子宫NOS

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基因组分类Ductal and Lobular NeoplasmsComplex Mixed and Stromal NeoplasmsBlood Vessel TumorsFibromatous NeoplasmsEpithelial Neoplasms, NOSMature T- and NK-Cell LymphomasComplex Epithelial NeoplasmsSquamous Cell NeoplasmsSoft Tissue Tumors and Sarcomas, NOSLymphoid LeukemiasCystic, Mucinous and Serous NeoplasmsGliomas
GDC HCMI-CMDC: NCI Cancer Model Development for the Human Cancer Model Initiative

基本信息

模态
基因组
大小
317056.197061374 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

GDC HCMI-CMDC:人类癌症模型倡议的NCI癌症模型开发

该数据集来自GDC的HCMI-CMDC项目,即人类癌症模型倡议的NCI癌症模型开发,属于肿瘤/乳腺癌分类。原发部位涵盖舌其他及未特指部位、胃、支气管和肺、喉、子宫NOS。疾病类型包括导管和小叶肿瘤、复杂混合和间质肿瘤、血管肿瘤、纤维瘤性肿瘤、上皮肿瘤NOS等。包含805例病例、43662个文件,总大小295281.6 GB,提供临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据,分为开放和受控访问层级,可用于癌症基因组学与模型开发研究(来源 portal.gdc.cancer.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):GDC项目HCMI-CMDC(人类癌症模型倡议的NCI癌症模型开发)。原发部位:舌其他及未特指部位、胃、支气管和肺、喉、子宫NOS。疾病类型:导管和小叶肿瘤、复杂混合和间质肿瘤、血管肿瘤、纤维瘤性肿瘤、上皮肿瘤NOS。项目:HCMI。病例数:805。文件数:43,662。总大小:295281.6 GB。NCI基因组数据共享协调癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA-Seq、WXS、甲基化和影像数据;开放和受控访问层级)。

【主题与分类】

主题标签:Ductal and Lobular Neoplasms、Complex Mixed and Stromal Neoplasms、Blood Vessel Tumors、Fibromatous Neoplasms、Epithelial Neoplasms, NOS、Mature T- and NK-Cell Lymphomas、Complex Epithelial Neoplasms、Squamous Cell Neoplasms、Soft Tissue Tumors and Sarcomas, NOS、Lymphoid Leukemias。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/HCMI-CMDC

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源站:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/HCMI-CMDC

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 317056.20 GB。

数据说明

GDC项目HCMI-CMDC(NCI癌症模型开发,服务于人类癌症模型计划)。原发部位:舌的其他及未特指部位、胃、支气管和肺、喉、子宫,NOS。疾病类型:导管和小叶肿瘤、复杂混合性和间质性肿瘤、血管肿瘤、纤维瘤性肿瘤、上皮性肿瘤,NOS。项目:HCMI。病例数:805。文件数:43,662。总大小:295281.6 GB。NCI基因组数据共享库统一癌症基因组学项目(临床、生物样本、RNA测序、全外显子组测序、甲基化及影像数据;开放和受控访问层级)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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