禁食周期抑制肿瘤生长并使多种癌细胞类型对化疗敏感

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-28556

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

短期饥饿（STS或禁食）对正常细胞、小鼠以及可能对患者提供保护，使其免受多种化疗药物的伤害，但其也可能保护肿瘤细胞的可能性使得其转化潜力充满不确定性。本研究表明，禁食周期可以像有毒的化疗药物一样有效，并且在治疗黑色素瘤、胶质瘤、乳腺癌和神经母细胞瘤时能增强化疗效果。在体外实验中，STS使测试的17种癌细胞系中的15种对化疗更为敏感。与化疗联合使用时，STS导致DNA损伤协同增加20倍，促衰老基因AKT和S6激酶的磷酸化增强，应激抵抗转录因子FOXO3a和NFkB的表达降低，超氧化物水平升高，以及caspase-3活化；所有这些变化在正常组织中均未观察到。其中一些效应与血红素加氧酶1（HO-1）的活性有关，其调节足以调控乳腺癌细胞中化疗依赖性的细胞死亡。这些研究表明，多次禁食周期有可能替代某些有毒的化疗药物，并使多种肿瘤对化疗更加敏感。

为了获得癌细胞在响应禁食时基因表达变化的无偏视图，我们采用Illumina的Sentrix MouseRef-8 v2表达珠芯片（Illumina，圣地亚哥，加州）进行了全基因组微阵列分析，样本来自balb-c小鼠的皮下4T1乳腺癌肿瘤块、心脏、肌肉和肝脏组织，这些小鼠分别接受了48小时禁食或自由饮食。禁食组和自由饮食组各使用三只小鼠进行芯片研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。