人原发性乳腺癌组织接受gemcitabine、epirubicine和docetaxel治疗前的表达谱分析
该数据集来源于omicsdi.org,收录了100例不同患者的人乳腺癌组织在接受初级全身化疗(gemcitabine、epirubicine和docetaxel)前的基因表达谱

基本信息
资源简介
人原发性乳腺癌组织接受gemcitabine、epirubicine和docetaxel治疗前的表达谱分析
该数据集为一份聚焦人乳腺癌组织基因表达谱的转录组学资源,来源于omicsdi.org,收录了100例不同患者的人乳腺癌组织样本。这些样本均在患者接受初级全身化疗之前采集,所用化疗方案包含吉西他滨(gemcitabine)、表柔比星(epirubicine)和多西他赛(docetaxel)三种药物。数据集的核心用途是记录并呈现上述组织在治疗前的基因表达特征,属于肿瘤学与乳腺癌研究领域的基础表达谱数据。通过这批治疗前样本的表达谱,研究者可以了解不同患者乳腺癌组织在未受该化疗方案影响时的转录组状态,为后续分析化疗反应、耐药机制或生物标志物提供基线信息。整体而言,该数据集以转录组学为主题标签,强调治疗前乳腺癌组织的表达谱分析,是乳腺癌系统治疗相关研究中的一类重要数据资源。
【数据集背景】
乳腺癌是肿瘤研究中的重点领域之一,针对乳腺癌的全身性化疗方案多种多样,其中包含吉西他滨、表柔比星和多西他赛的联合方案被用于初级全身化疗。该数据集正是在这一背景下产生,关注的是患者在接受上述化疗之前的人乳腺癌组织。通过获取治疗前的基因表达谱,研究者能够建立治疗前状态的分子画像,从而为理解后续治疗反应提供参照。该数据集来源于omicsdi.org,属于肿瘤/乳腺癌分类下的转录组学数据,其英文名称明确指向“人原发性乳腺癌组织在接受吉西他滨、表柔比星和多西他赛治疗前的表达谱分析”。这一背景说明该数据集并非关注治疗后变化,而是聚焦于治疗前基线表达特征,适合用于与治疗反应相关的比较研究或分子分型探索。
【数据内容】
该数据集的内容为基因表达谱,样本来自100例不同患者的人乳腺癌组织。根据源站描述,这些组织被用于进行表达谱分析,且均是在患者接受初级全身化疗之前获取。数据集的主题标签为Transcriptomics,表明其属于转录组学层面的数据。源站描述中提及的关键词包括“expression profiling”和“Human breast cancer tissues from 100 patients”,进一步确认了数据内容围绕100例患者乳腺癌组织的表达谱展开。数据所涉及的治疗药物为吉西他滨、表柔比星和多西他赛,但表达谱本身反映的是治疗前状态。关于具体的基因数量、表达检测平台、数据格式、样本分组细节、临床信息字段等,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。源站描述指出,来自100例不同患者的人乳腺癌组织被用于表达谱分析,这些组织均在初级全身化疗之前采集,化疗药物包括吉西他滨、表柔比星和多西他赛。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息、患者纳入与排除标准、组织处理流程、RNA提取方法、表达谱检测技术等,源站未提供。数据集的来源站为omicsdi.org,本站分类为肿瘤/乳腺癌,主题标签为Transcriptomics。除上述信息外,未提供更多关于采集与来源的细节。
【适用场景】
基于该数据集的内容,其适用场景主要包括:乳腺癌治疗前基因表达谱的分析;针对接受吉西他滨、表柔比星和多西他赛初级全身化疗的患者群体,探索治疗前分子特征;转录组学层面的乳腺癌研究;以及作为治疗前基线数据,用于与治疗后样本或其他队列进行比较分析。由于数据集明确标注为Transcriptomics,并聚焦于人乳腺癌组织,因此适合用于表达谱相关的生物信息学分析、分子分型研究或化疗反应相关标志物的初步筛选。但具体适用场景需结合源站未提供的平台信息、临床注释和分析目标来确定,源站未提供更具体的适用建议。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、预处理步骤、标准化方法、分析工具或代码等。用户如需使用,应参考来源站omicsdi.org的相关说明。源站未提供关于数据访问权限、是否需要注册、是否开放下载等信息。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量评估、样本质量、数据完整性、批次效应、技术偏差或验证结果的信息。已知的限制包括:数据集仅包含治疗前样本,不包含治疗后表达谱;样本量为100例患者,但未提供患者临床特征、分子亚型、治疗反应等注释信息;源站描述较为简短,未说明检测平台、数据维度或质控标准。因此,在使用该数据集时,需注意其范围仅限于治疗前乳腺癌组织的表达谱,且相关质量与限制细节源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息。用户在使用前应查阅来源站omicsdi.org的相关页面以获取引用与许可要求。源站未提供具体的引用文献、DOI或数据使用协议。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-4056
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
100名接受原发性全身化疗(吉西他滨、表柔比星和多西他赛)的不同患者的乳腺癌症组织基因表达谱
关键词:表达谱分析
已使用来自100名患者的乳腺癌症组织进行表达谱分析。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
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