ena-DATASET-MUG-24-06-2016-09:45:40:262-333 样本集

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ena-DATASET-MUG-24-06-2016-09:45:40:262-333 样本集

ena-DATASET-MUG-24-06-2016-09:45:40:262-333 - samples 是一个收录于 omicsdi.org 的肿瘤/乳腺癌相关数据集，主题标签为 Genomics。该数据集的核心内容是血浆 DNA 的低覆盖全基因组测序数据，样本来自非癌症供体，包括 50 名男性和 54 名女性。此外，数据集中还包含两名转移性乳腺癌患者以更高深度在 NextSeq 平台上完成测序的数据。为分析核小体定位，所有非癌症对照的数据被合并处理。该数据集可用于基因组学相关研究，尤其是涉及血浆游离 DNA 与核小体定位分析的方向。

【数据集背景】

该数据集归属于肿瘤/乳腺癌分类，主题标签为 Genomics，来源站为 omicsdi.org。从研究背景看，数据集围绕血浆 DNA 的全基因组测序展开，既包含非癌症供体的低覆盖测序数据，也包含转移性乳腺癌患者的高深度测序数据，体现了以非癌症对照为参照、结合癌症样本进行对比分析的思路。核小体定位分析是该数据集明确提及的分析用途之一，为此非癌症对照数据被合并使用。

【数据内容】

数据集包含两类测序内容：其一为 50 名男性与 54 名女性非癌症供体的血浆 DNA 低覆盖全基因组测序数据；其二为两名转移性乳腺癌患者的数据，这些样本在 NextSeq 平台上以更高深度完成测序。非癌症对照的全部数据被合并，用于核小体定位分析。数据集名称中包含“samples”字样，表明其以样本为单位组织。除上述内容外，源站未提供更细的样本编号、文件清单或数据规模说明。

【采集与来源】

数据来源站为 omicsdi.org。样本类型为血浆 DNA，测序策略为全基因组测序，其中非癌症供体为低覆盖测序，两名转移性乳腺癌患者样本为更高深度测序，测序平台为 NextSeq。非癌症供体的性别构成明确为 50 名男性与 54 名女性。关于样本采集地点、时间、伦理审批及具体建库方法，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于基因组学范畴内以血浆 DNA 为对象的研究，尤其是核小体定位分析——非癌症对照数据已被合并以支持此类分析。同时，由于包含转移性乳腺癌患者的高深度测序数据，也可用于癌症与对照之间的对比性探索。主题标签为 Genomics，分类为肿瘤/乳腺癌，提示其适用方向集中在肿瘤基因组学与血浆游离 DNA 研究领域。其他具体应用场景源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时，可将合并后的非癌症对照数据作为核小体定位分析的背景或参照，并结合两名转移性乳腺癌患者的高深度数据开展对比。由于非癌症对照为低覆盖测序、患者样本为更高深度测序，两者在覆盖度上存在差异，分析时需加以考虑。关于具体的下载方式、文件格式、预处理流程与推荐分析工具，源站未提供。

【质量与限制】

非癌症对照数据为低覆盖全基因组测序，患者样本为更高深度测序，覆盖度不一致是该数据集在设计与使用中的一项客观特征。非癌症供体共 104 人（50 名男性、54 名女性），癌症样本仅两名患者，样本量方面的信息如上所述。关于数据质量评估指标、测序深度具体数值、污染控制与批次信息，源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。