miR-145-3p和145-5p下调是绝经后乳腺癌风险的长期预测因子:ORDET前瞻性研究

该数据集来自ORDET前瞻性研究,包含健康女性乳腺癌发生前外周血buffy coat的microRNA表达谱。研究检测了从buffy coat提取的总RNA中的microRNA表达,旨在分析miR-145-3p和145-5p下调与绝经后乳腺癌风险的长期预测关系

omicsdi
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基因组预测Transcriptomics
Downregulation of micro RNAs 145-3p and 145-5p is a Long-Term Predictor of Postmenopausal Breast Cancer Risk: the ORDET prospective study

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

miR-145-3p和145-5p下调是绝经后乳腺癌风险的长期预测因子:ORDET前瞻性研究

该数据集围绕绝经后乳腺癌风险的长期预测问题,聚焦于外周血buffy coat中microRNA表达变化,尤其是miR-145-3p与miR-145-5p的下调现象。数据来源于ORDET前瞻性研究,采集的是健康女性在乳腺癌发生之前的血液样本,并通过从buffy coat提取的总RNA进行microRNA表达谱检测。整体来看,该数据集属于肿瘤/乳腺癌领域,主题标签为Transcriptomics,适合用于探索microRNA表达与乳腺癌发生风险之间的前瞻性关联,尤其是围绕miR-145-3p和145-5p作为长期预测标志物的潜在价值。其核心特点在于“发生前”采样,为研究早期分子事件与后续乳腺癌风险之间的关系提供了基础数据。

【数据集背景】

该数据集来自ORDET前瞻性研究,研究背景指向绝经后乳腺癌风险的长期预测。其英文名称明确表达了研究重点:miR-145-3p和145-5p的下调被视为绝经后乳腺癌风险的长期预测因素。该数据集所属分类为肿瘤/乳腺癌,主题标签为Transcriptomics,说明其关注的是转录层面的分子表达信息。源站描述提到,该数据涉及健康女性在乳腺癌发生之前的microRNA表达谱,研究对象为尚未发生乳腺癌的健康女性,因此具有前瞻性队列研究的特征。源站未提供ORDET研究的更详细队列设计、随访年限、样本量或人群地理信息。

【数据内容】

数据内容为microRNA表达谱,来源于健康女性乳腺癌发生前的外周血buffy coat。源站描述指出,microRNA表达是从buffy coat提取的总RNA中评估得到的。这意味着数据集的核心内容是buffy coat来源总RNA中的microRNA表达信息,而非其他组织或血浆、血清等样本类型。主题标签为Transcriptomics,进一步表明其属于转录组学范畴。该数据集特别关注miR-145-3p和145-5p的下调现象,并将其与绝经后乳腺癌风险的长期预测联系起来。除上述内容外,源站未提供具体的microRNA数量、检测平台、表达矩阵格式、样本分组细节或统计结果。

【采集与来源】

采集对象为健康女性,采集时间点位于乳腺癌发生之前。样本类型为外周血buffy coat,检测材料为从buffy coat提取的总RNA。源站描述强调,microRNA表达是在乳腺癌发生前从健康女性buffy coat中评估的。来源站为omicsdi.org。该数据集属于ORDET前瞻性研究的一部分。除这些信息外,源站未提供具体的采血流程、样本保存条件、RNA提取方法、测序或芯片平台、数据生成时间以及伦理审批信息。

【适用场景】

该数据集适用于乳腺癌早期分子标志物研究,尤其是围绕绝经后乳腺癌风险的前瞻性分析。由于数据来自乳腺癌发生前的健康女性,可用于探索microRNA表达变化是否在疾病发生之前已经出现,并评估miR-145-3p和145-5p下调与后续乳腺癌风险之间的长期预测关系。其转录组学属性也使其适合用于microRNA表达谱分析、标志物筛选以及与其他乳腺癌相关转录组数据的比较研究。源站未提供该数据集在药物研发、临床诊断或预后模型中的具体应用案例。

【使用方法】

源站未提供具体的数据下载方式、文件格式、预处理流程、标准化方法、分析工具或代码示例。该数据集标注为Transcriptomics,并来源于omicsdi.org,但关于如何访问、解析或复用该数据,源站未提供进一步说明。

【质量与限制】

源站未提供样本量、随访完整性、批次效应、技术重复、数据缺失率或验证实验等信息。由于数据仅涉及buffy coat来源的microRNA表达,且描述中未提及其他组织或平台验证,其结论外推需谨慎。该数据集聚焦于绝经后乳腺癌风险,未提供其他乳腺癌亚型或人群的适用性信息。源站未提供质量控制指标或局限性说明。

【引用与许可】

源站未提供引用格式、许可协议、使用限制或数据共享政策。该数据集来源于omicsdi.org,并属于ORDET前瞻性研究,但关于如何正确引用或是否允许再分发,源站未提供相关信息。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-54470

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

健康女性乳腺癌发生前白膜层的microRNA表达谱。从白膜层提取的总RNA中评估microRNA表达。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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