原发乳腺肿瘤进展为远处转移的基因差异表达与蛋白网络数据集
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦原发乳腺肿瘤进展为远处转移的基因差异表达与蛋白网络，属于肿瘤/乳腺癌方向。源站描述显示，研究对印度乳腺癌患者队列进行3至5年随访的基因表达谱分析，并与既往已发表的高加索人队列数据比较，识别出与远处转移相关的基因特征，且该关联不受激素受体状态影响；结果还显示免
基本信息
资源简介
原发乳腺肿瘤进展为远处转移的基因差异表达与蛋白网络数据集
该数据集英文名为“Differential expression of genes and protein networks in the primary breast tumor that proceed to distant metastasis”，来自 omicsdi.org，归类于肿瘤/乳腺癌方向，主题标签为转录组学（Transcriptomics）。数据集聚焦原发乳腺肿瘤进展为远处转移过程中的基因差异表达与蛋白网络，源站描述显示，研究对印度乳腺癌患者队列进行了3至5年随访的基因表达谱分析，并与既往已发表的高加索人队列数据进行比较，识别出与远处转移相关的基因特征；该关联不受激素受体状态影响。研究结果还显示，在发生远处转移的患者中，与免疫系统发育和应答相关的基因受到抑制，而DNA复制相关因子则上调。以下依据可获得的信息对该数据集作进一步介绍。
【数据集背景】
源站描述指出，淋巴结转移的存在与否在预后预测和后续患者管理中起重要作用。然而，相当比例淋巴结阳性的患者在初始治疗后3年或更长时间内保持无病状态，而三分之一在初诊时淋巴结阴性的患者在同一时期内发生远处转移。这一临床异质性构成了该研究的问题背景：仅凭淋巴结状态难以充分预测远处转移风险，因此需要通过基因表达谱分析寻找与远处转移相关的分子特征。研究据此对印度乳腺癌患者队列开展基因表达谱分析，并与既往已发表的高加索人队列数据进行比较。
【数据内容】
该数据集的主题标签为转录组学，内容围绕原发乳腺肿瘤进展为远处转移的基因差异表达及蛋白网络。源站描述表明，研究识别出与远处转移相关的基因特征，且该关联不受激素受体状态影响；结果还显示免疫系统发育和应答相关基因在发生远处转移的患者中受到抑制，DNA复制相关因子则上调。除上述信息外，数据集所包含的具体样本数量、基因或蛋白条目数、数据文件格式等，源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述显示，研究对印度乳腺癌患者队列进行基因表达谱分析，随访期为3至5年，并与既往已发表的高加索人队列数据进行比较。关于样本采集的具体机构、伦理审批信息、测序或芯片平台型号等，源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述，该数据集可用于研究与原发乳腺肿瘤远处转移相关的基因表达差异和蛋白网络，也可用于比较不同人群队列（印度队列与高加索人队列）中与远处转移相关基因特征的一致性，并可用于探讨这些特征与激素受体状态无关的关联模式，以及免疫系统发育和应答基因抑制、DNA复制因子上调这一表达模式。其他具体应用场景源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件组织说明、分析流程或配套工具等。
【质量与限制】
源站描述提及研究设有3至5年随访，并与既往发表的高加索人队列数据进行比较，但未提供样本量、数据完整性、批次效应处理、统计显著性指标等质量相关信息。该数据集在人群构成上涉及印度乳腺癌患者队列，其结论向其他人群推广时的适用性需结合源站描述中与高加索人队列的比较结果加以考量。其他质量与限制信息源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE40206
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
淋巴结转移的存在与否在预后预测和后续患者管理中起着重要作用。然而，相当比例淋巴结阳性的患者在初始治疗后3年或更长时间内保持无病状态，而三分之一初诊时淋巴结阴性的患者在同一时期内发生远处转移。我们对一个随访3-5年的印度乳腺癌患者队列进行了基因表达谱分析，并与先前发表的高加索人队列数据进行比较，鉴定出与远处转移相关的基因特征。这种关联与激素受体状态无关。我们的结果表明，在发生远处转移的患者中，标志免疫系统发育和应答的基因受到抑制，而DNA复制相关因子则上调。大量编码参与有丝分裂纺锤体形成且属于TRIM28蛋白网络的基因在转移性肿瘤中存在差异性调控。
此外，在小鼠骨转移模型中报道的基因与我们队列中发生骨转移的患者之间存在显著重叠。总之，我们首次提出了可能与乳腺癌患者远处转移相关的基因特征，且不受淋巴结或激素受体状态的影响。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
