原发乳腺癌患者循环肿瘤DNA连续监测用于检测隐匿性转移的数据
该数据集来自一项回顾性研究,纳入20例原发乳腺癌并长期随访的患者,结合原发肿瘤低覆盖度全基因组测序与血浆中肿瘤特异性重排的微滴数字PCR定量,评估循环肿瘤DNA连续监测对转移的早期检测价值

基本信息
资源简介
原发乳腺癌患者循环肿瘤DNA连续监测用于检测隐匿性转移的数据
Data from: Serial monitoring of circulating tumor DNA in patients with primary breast cancer for detection of occult metastatic disease
该数据集来自一项回顾性研究,纳入20例原发乳腺癌并长期随访的患者,结合原发肿瘤低覆盖度全基因组测序与血浆中肿瘤特异性重排的微滴数字PCR定量,评估循环肿瘤DNA连续监测对转移的早期检测价值。研究显示ctDNA监测可高准确度区分术后最终临床确诊复发(93%)与未复发(100%)患者,并在86%的患者中早于临床检测到转移,平均提前11个月。数据可用于ctDNA检测方法验证、复发预测建模及液体活检相关研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2016。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):转移性乳腺癌通常在出现症状后才被诊断,此时几乎无法治愈。游离循环肿瘤DNA(ctDNA)含有肿瘤特异性染色体重排,可在血浆中进行检测。我们在一项纳入20例原发乳腺癌并长期随访患者的回顾性研究中,评估了连续监测ctDNA以早期检测转移的价值。采用结合原发肿瘤低覆盖度全基因组测序与通过微滴数字PCR定量血浆中肿瘤特异性重排的方法,我们首次发现ctDNA监测在术后区分最终临床检测到复发(93%)与未检测到复发(100%)的患者方面具有高度准确性。在86%的患者中,基于ctDNA的检测早于转移的临床检测,平均提前时间为11个月。
【主题与分类】
主题标签:Metastasis、whole-genome sequencing、Breast cancer、Circulating tumor DNA。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.b6928
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.b6928
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 158.5 MB。
数据说明
转移性乳腺癌通常在出现症状后才被诊断,而此时几乎无法治愈。游离循环肿瘤DNA(ctDNA)含有肿瘤特异性的染色体重排,可在血浆中进行检测。我们在一项回顾性研究中,对20例确诊为原发性乳腺癌并接受长期随访的患者进行了ctDNA连续监测,以评估其用于早期发现转移的价值。通过结合原发肿瘤的低覆盖度全基因组测序和利用微滴数字PCR对血浆中肿瘤特异性重排进行定量,我们首次发现,ctDNA监测在术后区分最终临床检测到复发(93%)与未检测到复发(100%)的患者方面具有高度准确性。在86%的患者中,基于ctDNA的检测早于临床转移检测,平均提前11个月(范围0–37个月),而长期无病生存的患者术后ctDNA检测不到。ctDNA数量可预测不良生存。
这些发现为在早期乳腺癌中开展更大规模的验证性研究奠定了基础,旨在评估循环肿瘤DNA作为监测工具,用于早期转移检测、治疗调整,并有助于避免过度治疗。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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