阴道拭子和血浆深度测序的子宫内膜癌患者基因组分析数据集
包含子宫内膜癌患者阴道拭子和血浆深度测序的突变数据与临床信息，用于基因组分析。
基本信息
资源简介
阴道拭子和血浆深度测序的子宫内膜癌患者基因组分析数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genomic Profiling in Patients with Endometrial Cancer by Deep Sequencing of Vaginal Swabs and Plasma》。源站首次发布：2025-05-12。
【数据内容】
源站原始描述：De-identified mutation data in MAF format and clinical information in CSV format for ''Genomic Profiling in Patients with Endometrial Cancer by Deep Sequencing of Vaginal Swabs and Plasma'' in Clinical Cancer Research
主表 TotalHistory_Anonymized.csv 含 26 列、样本前 192 行结构完整。
主表 output_Anonymized_Swab.maf 含 12 列、样本前 1174 行结构完整。
主表 output_Anonymized_Totalblood.maf 含 12 列、样本前 511 行结构完整。
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个，合计 146.56 KB。TotalHistory_Anonymized.csv：text/csv，20.92 KB。output_Anonymized_Swab.maf：text/plain，88.29 KB。output_Anonymized_Totalblood.maf：text/plain，37.34 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.28434974.v2。
【主题与分类】
源站学科分类：Cancer genetics。主题标签：Vaginal swab DNA、Circulating tumor DNA、Endometrial cancer。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Genomic_Profiling_Using_Vaginal_Swab_and_Plasma_in_Patients_with_Endometrial_Cancer_by_Deep_Sequencing/28434974
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Kim, Namsoo; Kim, Yoo-Na; Lee, Seung-Tae; Lee, Jung-Yun (2025). Genomic Profiling in Patients with Endometrial Cancer by Deep Sequencing of Vaginal Swabs and Plasma. figshare. Dataset
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Genomic Profiling in Patients with Endometrial Cancer by Deep Sequencing of Vaginal Swabs and Plasma
- DOI：10.6084/m9.figshare.28434974.v2
- 发布日期：2025-05-12
- 文件数：3 个
- 文件总体积：146.56 KB
- 源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Genomic_Profiling_Using_Vaginal_Swab_and_Plasma_in_Patients_with_Endometrial_Cancer_by_Deep_Sequencing/28434974
命令行下载
curl -L -o "TotalHistory_Anonymized.csv" "https://ndownloader.figshare.com/files/52431341"
curl -L -o "output_Anonymized_Swab.maf" "https://ndownloader.figshare.com/files/52431344"
curl -L -o "output_Anonymized_Totalblood.maf" "https://ndownloader.figshare.com/files/52431338"
文件清单
TotalHistory_Anonymized.csv（20.92 KB）output_Anonymized_Swab.maf（88.29 KB）output_Anonymized_Totalblood.maf（37.34 KB）
文件总体积 146.56 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
数据说明
De-identified mutation data in MAF format and clinical information in CSV format for ‘‘Genomic Profiling in Patients with Endometrial Cancer by Deep Sequencing of Vaginal Swabs and Plasma’’ in Clinical Cancer Research.
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.28434974.v2（source: https://figshare.com/articles/dataset/Genomic_Profiling_Using_Vaginal_Swab_and_Plasma_in_Patients_with_Endometrial_Cancer_by_Deep_Sequencing/28434974）。
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