CTDvic:用于鉴定和临床解释癌症中 ctDNA 驱动基因和变异的综合数据库
CTDvic 是一个专注于癌症中循环肿瘤DNA (ctDNA) 变异和驱动基因的综合数据库,其数据模态主要包括基因变异注释和临床解释信息。该数据库整合了手动整理的1,674例已验证ctDNA变异的临床解读,并提供了一个从公开ctDNA突变谱中识别驱动基因与变异的分析流程,覆盖了17种癌症类型。其主要用途是服务于液体活检诊断和癌症基因组学研究,为ctDNA变异的分子诊断、预后评估以及治疗决策提供系统性的数据支持和分析工具。

基本信息
资源简介
CTDvic:用于鉴定和临床解释癌症中 ctDNA 驱动基因和变异的综合数据库
【数据集背景】
本数据集源站标题为《CTDdgv: a comprehensive database for the identification and clinical interpretation of ctDNA driver genes and variants in cancer》。源站首次发布:2025-01-16。
【数据内容】
源站原始描述:Circulating tumor DNA (ctDNA) variants hold significant promise as cancer biomarkers in liquid biopsies, owing to their minimally invasive testing approach and capacity to capture the comprehensive tumor landscape. However, a comprehensive resource for studying ctDNA variants is still lacking. Here, we developed CTDdgv, which aims to identify ctDNA variants and interpret their clinical relevance systematically. We manually curated 1674 experimentally validated clinical interpretations for ctDNA…
主表 Prediction.csv 含 22 列、样本前 2000 行结构完整。
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个,合计 5.13 MB。gene.csv:text/csv,371.03 KB。mutation.csv:text/csv,740.10 KB。Prediction.csv:text/csv,4.02 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.28193990.v2。
【主题与分类】
源站学科分类:Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。主题标签:Circulating tumor DNA、Liquid biopsy、Driver gene & variant identification pipeline、Clinical interpretation of gene and variant。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/CTDvic__ctDNA__/28193990
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:wang, yuncong (2025). CTDdgv: a comprehensive database for the identification and clinical interpretation of ctDNA driver genes and variants in cancer. figshare. Dataset
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使用方式
数据集获取(Figshare)
源站:https://figshare.com/articles/dataset/CTDvic__ctDNA__/28193990/1
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
CTDvic 是一个专门针对癌症中循环肿瘤DNA (ctDNA) 变异与驱动基因的综合数据库。该数据库旨在系统性地识别ctDNA变异并解释其临床相关性。它包含两个核心部分:一是手动整理的1,674例经过实验验证的ctDNA变异临床解释,涵盖预后意义、耐药性、与肿瘤特征的关联、转移监测、治疗指导及检测前景等多个维度;二是集成了一个分析流程,用于从公开的ctDNA突变谱中识别肿瘤驱动基因和变异,并评估其预后意义。基于来自17种癌症类型、38个数据集的信息,CTDvic提供了特定癌症类型中驱动基因集的多维分析,为理解其驱动效应提供了深入见解。该数据集主要服务于液体活检诊断、癌症基因组学等领域的研究,是支持ctDNA变异分子诊断和治疗决策的宝贵资源。
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