男性乳腺癌BRCA2计算生物学研究数据:nsSNP预测与靶点识别

该数据集来自frontiersin.figshare.com,包含一份DataSheet文档,配套论文关注非转移性男性乳腺癌化疗对生存的影响

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2023-06-12 更新
浏览 3
基因组预测sexmalebreast cancerclinicopathological featuresprognosis
Data from: Computational Biology of BRCA2 in Male Breast Cancer, through Prediction of Probable nsSNPs, and Hit Identification

基本信息

模态
基因组
大小
0.037358864 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-12
版本
v1

资源简介

男性乳腺癌BRCA2计算生物学研究数据:nsSNP预测与靶点识别

DataSheet_1_Sex-Based Heterogeneity in the Clinicopathological Characteristics and Prognosis of Breast Cancer: A Population-Based Analysis.docx

该数据集来自frontiersin.figshare.com,包含一份DataSheet文档,配套论文关注非转移性男性乳腺癌化疗对生存的影响。源站描述显示研究基于SEER数据库2010至2016年乳腺癌患者数据,比较男性与女性乳腺癌的基线人口学与临床病理特征差异,并通过倾向性评分匹配进行校正分析,开展生存分析及单因素和多因素预后风险因素识别。数据可用于乳腺癌性别异质性、临床病理特征比较与预后预测研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《The effect of chemotherapy on survival in patients with nonmetastatic male breast cancer: A population‐based observational study》发表于 Cancer(2020),DOI:10.1002/cncr.32829。源站首次发布:2021-02-24。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:更好地理解男性乳腺癌(MBC)与女性乳腺癌(FBC)在临床病理特征和预后方面的差异。材料与方法:从监测、流行病学和最终结果数据库获取2010年1月1日至2016年12月31日诊断为乳腺癌的患者数据。将所选患者分为MBC和FBC,依次提取基线人口学与临床病理特征进行分析。进行比较分析以探究基线特征差异,随后采用倾向性评分匹配校准客观差异以进行校正分析。开展生存分析以研究两队列在预后方面呈现的差异,并依次使用单因素和多因素分析识别预后风险因素。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 37.36 MB。数据集 DOI:10.3389/fonc.2021.642450.s001。

【主题与分类】

源站学科分类:Cancer、Haematological Tumours、Radiation Therapy、Solid Tumours、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Molecular Targets。主题标签:sex、male、breast cancer、clinicopathological features、prognosis。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cancer、Haematological Tumours、Radiation Therapy、Solid Tumours、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Molecular Targets。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Sex-Based_Heterogeneity_in_the_Clinicopathological_Characteristics_and_Prognosis_of_Breast_Cancer_A_Population-Based_Analysis_docx/14102606

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Han, Yiqun; Wang, Jiayu; Wang, Zijing; Xu, Binghe (2021). DataSheet_1_Sex-Based Heterogeneity in the Clinicopathological Characteristics and Prognosis of Breast Cancer: A Population-Based Analysis.docx. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-12,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "DataSheet_1_Sex-Based Heterogeneity in the Clinicopathological Characteristics and Prognosis of Breast Cancer: A Population-Based Analysis.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/26603465"

文件清单

  • DataSheet_1_Sex-Based Heterogeneity in the Clinicopathological Characteristics and Prognosis of Breast Cancer: A Population-Based Analysis.docx(37.36 MB)

文件总体积 37.36 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

目的:更好地了解男性乳腺癌(MBC)与女性乳腺癌(FBC)在临床病理特征及预后方面的差异。材料与方法:从监测、流行病学和最终结果数据库获取2010年1月1日至2016年12月31日期间诊断为乳腺癌患者的数据。将入选患者分为MBC和FBC,依次提取其基线人口学特征和临床病理特征进行分析。通过比较分析探讨基线特征的差异,随后进行倾向评分匹配以校准客观差异,用于校正分析。开展生存分析以探究两队列在预后方面呈现的差异,并依次采用单因素和多因素COX回归分析识别预后危险因素。结果:共有407341例个体符合条件,包括3111例MBC(0.7%)和404230例FBC(99.3%)患者。

相比之下,MBC患者确诊时年龄往往较大,导管癌确诊比例更高,组织学分级更高,TNM分期更高,luminal样亚型比例更高,肺转移率更高,肝脏受累发生率较低,且接受手术、放疗和化疗的比例较低。MBC的总体预后显著差于FBC,中位总生存期差异逐渐缩小(65.5个月 vs. 72.7个月,P在本研究中,在乳腺癌患者总体人群中观察到基于性别的临床病理特征和预后特征异质性,且在不同亚组间存在显著差异。未来有必要开展针对男性、具有合理终点的特异性临床试验设计。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fonc.2021.642450.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Sex-Based_Heterogeneity_in_the_Clinicopathological_Characteristics_and_Prognosis_of_Breast_Cancer_A_Population-Based_Analysis_docx/14102606)。

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