caArray_gray-00215:用于研究功能不同癌症亚型的乳腺癌细胞系集合

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/乳腺癌分类,主题标签为 Transcriptomics。它收录了 51 株乳腺癌细胞系,其反复出现的基因组与转录特征与 145 例原发性乳腺肿瘤相似,同时保留了原发肿瘤中显著的基因组、转录和生物学异质性

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基因组分类Transcriptomics
caArray_gray-00215: A collection of breast cancer cell lines for the study of functionally distinct cancer subtypes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

caArray_gray-00215:用于研究功能不同癌症亚型的乳腺癌细胞系集合

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/乳腺癌分类,主题标签为 Transcriptomics。它收录了 51 株乳腺癌细胞系,其反复出现的基因组与转录特征与 145 例原发性乳腺肿瘤相似,同时保留了原发肿瘤中显著的基因组、转录和生物学异质性。该模型系统可用于评估基因对乳腺癌亚型的功能贡献,并以 Trastuzumab(Herceptin)单药治疗为例,识别预测或指示靶向治疗及其他生理扰动反应的分子特征(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):近期研究表明,当数千个基因因基因组或表观基因组事件而失调时,可能参与乳腺癌病理生理过程。在此,我们描述了一个模型系统,用于评估这些基因对乳腺癌亚型的功能贡献。总体而言,51 株乳腺癌细胞系反复出现的基因组和转录特征与 145 例原发性乳腺肿瘤相似,尽管也记录了一些显著差异。构成该系统的细胞系还表现出原发性肿瘤中存在的显著基因组、转录和生物学异质性。我们以 Trastuzumab(Herceptin)单药治疗为例表明,该系统可用于识别预测或指示对靶向治疗或其他生理扰动反应的分子特征。**注意:从 caArray 1.x 迁移,identifier='gov.nih.nci.ncicb.caarray

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-69017

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

近期研究表明,当数千个基因因基因组或表观基因组事件而失调时,它们可能参与乳腺癌的病理生理过程。在此,我们描述了一个模型系统,用以评估这些基因对乳腺癌亚型的功能性贡献。总体而言,51个乳腺癌细胞系的反复出现的基因组和转录特征与145个原发性乳腺肿瘤的特征相似,尽管也记录了一些显著差异。构成该系统的细胞系还表现出原发性肿瘤中所见的显著基因组、转录和生物学异质性。我们以曲妥珠单抗(赫赛汀)单药治疗为例,展示该系统可用于识别预测或指示对靶向治疗或其他生理扰动反应的分子特征。**注:从caArray 1.x迁移,标识符=‘gov.nih.nci.ncicb.caarray:Experiment:1015897590151581:1’ gray-00215 检测类型:基因表达 提供商:Affymetrix 芯片设计:HG-U133A 生物体:Homo sapiens (ncbitax)

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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