乳腺癌无复发生存数据集
该数据集来自 ebi.ac.uk,属于肿瘤/乳腺癌主题,包含 180 例淋巴结阴性无复发患者与 106 例发生远处转移的淋巴结阴性患者的转录组表达谱数据,主题标签为 transcription profiling by array 与 Homo sapiens

基本信息
资源简介
乳腺癌无复发生存数据集
Breast cancer relapse free survival 数据集收录于 ebi.ac.uk,归类于肿瘤 / 乳腺癌方向,主题标签为 transcription profiling by array 与 Homo sapiens。该数据集聚焦淋巴结阴性乳腺癌患者的复发与远处转移问题,包含 180 例淋巴结阴性且无复发的患者,以及 106 例淋巴结阴性但发生远处转移的患者,共计 286 例样本的转录组表达谱数据。数据集以基因表达谱为核心内容,可用于考察乳腺癌在淋巴结阴性人群中的复发风险与远处转移相关的转录层面特征。整体而言,该数据集面向乳腺癌预后研究,尤其是围绕无复发生存与远处转移这一临床关注点提供表达谱层面的观察材料,适合在肿瘤转录组学与乳腺癌预后标志物探索等方向中作为研究资源使用。
【数据集背景】
乳腺癌是肿瘤研究中的重要方向,患者预后差异与是否发生复发、远处转移密切相关。淋巴结阴性患者群体在临床上通常被认为风险相对较低,但其中仍有部分患者会出现复发或远处转移,如何从分子层面识别这类人群是相关研究的关注点。该数据集正是围绕这一背景组织:以淋巴结阴性患者为对象,区分无复发患者与发生远处转移的患者,形成可用于比较的表达谱集合。数据集所属分类为肿瘤 / 乳腺癌,来源站为 ebi.ac.uk,主题标签为 transcription profiling by array 与 Homo sapiens,说明其数据类型为人类样本的转录组芯片表达谱。
【数据内容】
数据集包含 180 例淋巴结阴性无复发患者的表达谱数据,以及 106 例淋巴结阴性并发生远处转移患者的表达谱数据。源站描述同时提示可参考随附的患者临床参数表以获取更多信息,并给出了相应的 GEO 查询链接(GSE2034 相关页面)。数据以转录组表达谱为主体内容,主题标签为 transcription profiling by array,物种为 Homo sapiens。除上述样本数量与分组信息外,表达谱的具体基因数量、平台细节、临床参数表的具体字段等内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述中给出了指向 NCBI GEO(GSE2034)的查询链接,用于查看数据与患者临床参数表。样本来源为人类(Homo sapiens),数据产生方式为 transcription profiling by array,即基于芯片的转录谱检测。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、芯片平台型号与实验流程细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于乳腺癌预后相关的研究场景,尤其是淋巴结阴性患者中无复发生存与远处转移的分子特征比较。可用于探索与复发风险、远处转移相关的基因表达模式,也可作为转录组层面的验证或对照资源,支持乳腺癌生物标志物方向的探索性分析。由于主题标签为 transcription profiling by array 且物种为 Homo sapiens,其使用场景主要限定在人类乳腺癌转录组研究范围内。关于该数据集在其他癌种、其他平台或临床决策中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
使用时可依据源站描述中的 GEO 查询链接获取数据及患者临床参数表,按无复发与发生远处转移两组进行分组比较。分析思路可围绕两组间的表达差异、与无复发生存相关的表达特征等展开。由于源站未提供具体的预处理流程、归一化方法与推荐分析工具,相关操作需依据数据实际格式自行确定;样本分组信息应以源站描述及随附临床参数表为准。
【质量与限制】
该数据集的样本量为 180 例无复发与 106 例远处转移的淋巴结阴性患者,研究对象限定于淋巴结阴性人群,结论外推到淋巴结阳性或其他人群时需谨慎。源站描述较为简略,关键词标注为 other,未提供平台型号、数据质控指标、缺失值情况、随访时长与临床参数表的具体内容,因此无法据此评估数据质量细节。此外,源站未提供批次信息与数据更新情况,使用前应结合原始记录核实。
【引用与许可】
源站描述中给出了指向 NCBI GEO(GSE2034)的查询链接,可作为数据获取与引用的入口。关于该数据集的具体引用文献、作者列表、许可协议与使用条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-2034
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Tim Jatkoe (2005). Breast cancer relapse free survival [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-2034
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




