从血浆来源细胞外囊泡中发现并验证糖蛋白作为乳腺癌生物标志物的流程
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/乳腺癌分类，主题涉及细胞外囊泡、糖蛋白组学与生物标志物。研究提出一套流程，将定量糖蛋白组学与新型反相糖蛋白阵列整合，从细胞外囊泡中开发糖蛋白，并应用于识别乳腺癌新型生物标志物
基本信息
资源简介
从血浆来源细胞外囊泡中发现并验证糖蛋白作为乳腺癌生物标志物的流程
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/乳腺癌分类，主题涉及细胞外囊泡、糖蛋白组学与生物标志物。研究提出一套流程，将定量糖蛋白组学与新型反相糖蛋白阵列整合，从细胞外囊泡中开发糖蛋白，并应用于识别乳腺癌新型生物标志物。在EV中鉴定出1,453个独特糖肽，代表556个糖蛋白，其中20个在乳腺癌患者中显著升高，并进一步用糖特异性反相蛋白阵列对部分候选物进行定量。该数据可用于乳腺癌糖蛋白生物标志物的发现与验证研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：糖蛋白占目前FDA批准的蛋白质肿瘤标志物的一半以上，但作为疾病生物标志物的新糖蛋白的开发一直停滞不前。在此，我们提出了一套从细胞外囊泡（EVs）中开发糖蛋白的流程，将定量糖蛋白组学与新型反相糖蛋白阵列相结合，然后将其应用于识别乳腺癌的新型生物标志物。EV糖蛋白组学显示出有望规避当前血清糖蛋白组学所面临问题的前景，并使我们能够鉴定出数百种尚未在血清中鉴定出的糖蛋白。我们在EV中鉴定出1,453个独特糖肽，代表556个糖蛋白，其中20个在乳腺癌患者中显著更高。我们进一步应用了一种新型糖特异性反相蛋白阵列来量化一部分候选物。总之，这项研究证明了t
【主题与分类】
主题标签：Extracellular vesicles、Glycoproteomics、Biomarker。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD007572
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD007572
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
糖蛋白占目前FDA批准蛋白质肿瘤标志物的一半以上，但作为疾病生物标志物的新糖蛋白开发一直停滞不前。在此，我们提出了一种通过将定量糖蛋白质组学与新型反相糖蛋白阵列相结合，从细胞外囊泡(EVs)中开发糖蛋白的流程，并将其应用于识别乳腺癌的新型生物标志物。EV糖蛋白质组学在规避当前血清糖蛋白质组学所面临的问题方面显示出前景，并使我们能够识别数百种尚未在血清中发现的糖蛋白。我们在EVs中识别出代表556种糖蛋白的1，453个独特糖肽，其中20种在乳腺癌患者中显著升高。我们进一步应用了一种新型糖特异性反相蛋白阵列来量化一部分候选物。总之，这项研究证明了这种整合流程在生物标志物发现方面的巨大潜力。
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