UniGeneX 胶质母细胞瘤 UGE 图谱与 Visium 反卷积教程数据集
该数据集面向 UniGeneX 胶质母细胞瘤教程及论文图 5B-C、6C-D，包含整合的胶质瘤通用基因表达（UGE）图谱、两个 GBM-Space Visium 切片、UGE 细胞状态特征以及预计算的 Cell2location 丰度估计
基本信息
资源简介
UniGeneX 胶质母细胞瘤 UGE 图谱与 Visium 反卷积教程数据集
UniGeneX Glioblastoma UGE Atlas and Visium Deconvolution Tutorial Dataset
该数据集面向 UniGeneX 胶质母细胞瘤教程及论文图 5B-C、6C-D，包含整合的胶质瘤通用基因表达（UGE）图谱、两个 GBM-Space Visium 切片、UGE 细胞状态特征以及预计算的 Cell2location 丰度估计。数据以三个模块化归档发布，所有路径以 GBM/ 开头，可解压至共享数据根目录，并附文件级清单、校验和、许可说明与解压辅助工具。Visium 数据源自 GBM-Space 与 de Jong 等（bioRxiv, 2025）。该数据可用于空间转录组反卷积、细胞状态解析及教程复现（来源 DOI 解析，Creative Commons Attribution Non Commercial No Deri。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集支持 UniGeneX 胶质母细胞瘤教程及手稿图 5B-C 和 6C-D。它包含整合的胶质瘤通用基因表达（UGE）图谱、两个 GBM-Space Visium 切片、UGE 细胞状态特征以及预计算的 Cell2location 丰度估计。该发布组织为三个模块化归档。所有归档路径均以 GBM/ 开头，因此所选模块可解压到一个共享数据根目录中。包含文件级清单、校验和、许可说明以及解压辅助工具。生成的图由 notebook 复现，不作为单独的数据文件捆绑。Visium 数据来源于 GBM-Space 和 de Jong 等人，bioRxiv (2025)，DOI 10.1101/2025.05.13.653495。代码、文档和 notebook 维护于
【主题与分类】
主题标签：UniGeneX、glioblastoma、glioma、single-cell RNA sequencing、Visium、spatial transcriptomics、Cell2location、universal gene expression、reproducibility。本站分类：肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22566537
使用许可：Creative Commons Attribution Non Commercial No Derivatives 4.0 International。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.22566537
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 18.84 GB。
数据说明
该数据集支持 UniGeneX 胶质母细胞瘤教程以及手稿图 5B-C 和 6C-D。它包含整合的胶质瘤通用基因表达（UGE）图谱、两个 GBM-Space Visium 切片、UGE 细胞状态特征以及预计算的 Cell2location 丰度估计。该发布版本组织为三个模块化归档文件。所有归档路径均以 GBM/ 开头，因此可将选定的模块提取到同一个共享数据根目录中。其中包含文件级清单、校验和、许可说明以及提取辅助工具。生成的图由 notebook 复现，不作为单独的数据文件打包提供。Visium 数据来源于 GBM-Space 和 de Jong 等人，bioRxiv (2025)，DOI 10.1101/2025.05.13.653495。代码、文档和 notebook 维护于 https://github.com/xwanaf/UniGeneX。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
