CPTAC胶质母细胞瘤临床蛋白质组肿瘤分析联盟数据集

本数据集包含来自美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟( Cancer Imaging Archive)收集并公开提供,以使研究人员能够研究可能与相应蛋白质组、基因组和临床数据相关的癌症表型

The Cancer Imaging ArchiveThe Cancer Imaging Archive
datacite
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医学影像分类肿瘤脑肿瘤胶质母细胞瘤蛋白质基因组学影像数据
The Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium Glioblastoma Multiforme Collection (CPTAC-GBM)

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
许可
NIH Controlled Data Access Policy
创建/更新时间
2026-10-23
版本
17

资源简介

CPTAC胶质母细胞瘤临床蛋白质组肿瘤分析联盟数据集

The Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium Glioblastoma Multiforme Collection(CPTAC-GBM)是一个聚焦于胶质母细胞瘤的肿瘤影像数据集,归属于肿瘤/脑肿瘤分类,来源站为 doi.org,由美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)作为作者发布,收藏机构为 The Cancer Imaging Archive,发布时间为 2018 年。该数据集汇集了 CPTAC-GBM 队列受试者的影像资料,旨在配合蛋白质组、基因组与临床数据,支持研究人员探索可能与分子层面特征相关的癌症表型。数据集采用 NIH Controlled Data Access Policy 许可,属于受控访问数据。

【数据集背景】

CPTAC 是美国国家癌症研究所发起的一项全国性工作,目标是通过大规模蛋白质组与基因组分析(即蛋白质基因组学)加速对癌症分子基础的理解。CPTAC-GBM 队列正是这一框架下针对胶质母细胞瘤的研究集合。The Cancer Imaging Archive 负责收集 CPTAC 患者的放射学与病理学图像并向公众开放,使这些影像能够与对应的蛋白质组、基因组和临床数据建立联系,从而为研究癌症表型与分子数据之间的相关性提供基础资源。

【数据内容】

该数据集收录的是来自 CPTAC-GBM 队列受试者的资料。根据源站描述,其中包含 CPTAC 患者的放射学图像与病理学图像,这些图像由 The Cancer Imaging Archive 收集并公开提供。数据集整体围绕胶质母细胞瘤这一脑肿瘤类型组织,属于肿瘤/脑肿瘤分类下的影像资源。关于具体影像模态构成、病例数量、文件格式与目录结构等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)的胶质母细胞瘤队列。作者标注为 National Cancer Institute Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC),机构为 The Cancer Imaging Archive,来源站为 doi.org,发布年份为 2018 年。源站描述说明,这些影像来自 CPTAC 患者,由 The Cancer Imaging Archive 负责收集与公开,目的是让研究人员能够研究与蛋白质组、基因组及临床数据可能相关的癌症表型。

【适用场景】

该数据集适用于研究胶质母细胞瘤的癌症表型,并探索这些影像表型与相应蛋白质组、基因组和临床数据之间的潜在关联。由于 CPTAC 的整体目标是借助大规模蛋白质组与基因组分析推进对癌症分子基础的理解,该影像集合可作为蛋白质基因组学研究中的影像学配套资源,用于多模态数据的关联分析。关于更具体的分析任务类型或已验证的应用案例,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 doi.org 来源站提供访问入口,由 The Cancer Imaging Archive 收集并公开提供。由于采用 NIH Controlled Data Access Policy 许可,属于受控访问数据,使用者需遵循相应的受控数据访问政策获取与使用数据。关于具体的申请流程、访问条件、下载方式及使用条款细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为受控访问数据,使用受 NIH Controlled Data Access Policy 约束。其内容定位于 CPTAC-GBM 队列患者的放射学与病理学图像,用于与蛋白质组、基因组和临床数据关联研究。关于数据完整性、标注质量、样本量、缺失情况或已知偏差等质量层面的具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

使用该数据集时应引用 The Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium Glioblastoma Multiforme Collection (CPTAC-GBM),作者为 National Cancer Institute Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC),机构为 The Cancer Imaging Archive,发布年份 2018,来源站为 doi.org。许可方面适用 NIH Controlled Data Access Policy,数据属受控访问。关于具体引用格式、版本号或数据使用协议的完整文本,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.7937/k9/tcia.2018.3rje41q1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本集合包含来自美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(https://proteomics.cancer.gov/programs/cptac)多形性胶质母细胞瘤(CPTAC-GBM)队列的受试者。CPTAC是一项全国性努力,旨在通过应用大规模蛋白质组和基因组分析(即蛋白质基因组学)来加速对癌症分子基础的理解。癌症影像档案库正在收集并公开提供CPTAC患者的放射学和病理学图像,以使研究人员能够研究可能与相应蛋白质组、基因组和临床数据相关的癌症表型。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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