CNS 髓系单细胞 RNA-seq 元图谱

数据集获取

源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.31926300

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 11.70 GB。

数据说明

髓系单细胞元图谱 该数据集包含用于Savage等人《自然》（2026）研究的中枢神经系统单细胞RNA-seq髓系元图谱。本次发布包括Matrix Market格式的稀疏细胞×基因计数矩阵（207,997个细胞）、条形码和特征表、协调后的细胞级元数据、样本级元数据。该图谱涵盖11种中枢神经系统相关疾病和背景：阿尔茨海默病、脑转移、发育、胶质瘤、健康/对照、髓母细胞瘤、多发性硬化、原发性中枢神经系统淋巴瘤、帕金森病、原发性GBM和复发性GBM。细胞元数据提供协调后的注释，包括细胞ID、样本ID、研究/队列、病因/诊断，以及可用的推断状态/亚型，同时保留来自源对象的原始单细胞元数据。样本元数据汇总每个样本贡献的细胞数量。该资源旨在支持中枢神经系统髓系异质性的可重复分析和跨研究比较。

Savage N., Grewal S., Shaikh V., Zemp F., McKenna D., Mikolajewicz N., Najem H., Pyczek J., Wei J., Taleb M., Asselstine L., Anand A., Chafe S., Zhai K., Maich W., Chokshi C., Patel H., Korman T., Subapanditha M., Shapovalova Z., Tatari N., Miltec P., Chen D., Pacheco S., Han H., Chan J., Brown K., Venugopal C., Kislinger T., Heimberger A., Moffat J., Mahoney D., Singh S. (2026). 利用GPNMB CAR-T细胞对胶质母细胞瘤进行肿瘤-髓系双重靶向治疗。Nature。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。