CDKN2A重塑脂质代谢使胶质母细胞瘤对铁死亡敏感

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA965893

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们创建了一个资源库，包含来自超过175个分子多样性胶质瘤肿瘤及其原位小鼠异种移植衍生模型和来自超过110个独特患者肿瘤系的胶质球培养物的转录组（RNAseq）、基因组（全外显子组测序）和脂质组（非靶向鸟枪法）分析数据。该数据集提供了匹配的批量RNA和全外显子双端测序数据，这些数据来自切除的胶质瘤及其衍生模型系统，并在Illumina HiSeq和NovaSeq测序仪上进行。这一综合数据集支持多项研究，旨在揭示胶质瘤内异质性和扰动反应的分子特征。通过Minami等人2023年（PMID：37236196）的综合多组学分析，我们发现CDKN2A缺失重塑了GBM……（更多内容见dbGaP研究页面。）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。