替莫唑胺对RTK I甲基化组外MGMT启动子甲基化恶性星形细胞瘤老年患者的相关性[HD队列]

总体设计:使用Illumina 450k/EPIC甲基化阵列对380例胶质母细胞瘤患者的FFPE或KRYO组织进行分析。请注意,该数据集仅包含甲基化分类器判定为RTK I、RTK II或mesenchymal的样本

ena
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文本分类肿瘤脑肿瘤胶质母细胞瘤DNA甲基化MGMT启动子甲基化替莫唑胺老年患者
PRJNA507175: Relevance of temozolomide for elderly patients with MGMT promoter-methylated malignant astrocytomas outside the RTK I methylation group [HD collective]

基本信息

模态
文本
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

替莫唑胺对RTK I甲基化组外MGMT启动子甲基化恶性星形细胞瘤老年患者的相关性[HD队列]

PRJNA507175 数据集收录了来自海德堡神经肿瘤中心的 380 例胶质母细胞瘤患者的 Illumina 450k/EPIC 阵列甲基化文件,属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,来源站为 ebi.ac.uk。该数据集围绕老年 MGMT 启动子甲基化恶性星形细胞瘤中替莫唑胺相关性这一主题,聚焦于 RTK I 甲基化组之外的病例,并以 HD collective 作为集合标识。其总体设计是对 380 例胶质母细胞瘤患者的 FFPE 或 KRYO 组织进行 Illumina 450k/EPIC 甲基化阵列分析,且仅纳入甲基化分类器判定为 RTK I、RTK II 或 mesenchymal 的样本。该数据集可为脑肿瘤甲基化分型及相关临床研究提供甲基化层面的数据支持。

【数据集背景】

该数据集来源于海德堡神经肿瘤中心,研究主题涉及老年患者中 MGMT 启动子甲基化的恶性星形细胞瘤,并探讨替莫唑胺在该人群中的相关性,尤其关注 RTK I 甲基化组之外的病例。数据集以 HD collective 作为集合标识,属于肿瘤 / 脑肿瘤领域,来源站为 ebi.ac.uk。源站描述指出,该数据包含来自海德堡神经肿瘤中心 380 例胶质母细胞瘤患者的 Illumina 450k/EPIC 阵列甲基化文件。整体来看,该数据集服务于胶质母细胞瘤甲基化分型与临床相关性研究的需要。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 Illumina 450k/EPIC 阵列甲基化文件,样本来自 380 例胶质母细胞瘤患者。源站描述明确,该数据集仅包含甲基化分类器判定为 RTK I、RTK II 或 mesenchymal 的样本。数据以甲基化阵列文件形式提供,涉及 FFPE 或 KRYO 组织的分析结果。除上述内容外,源站未提供关于具体文件格式、数据量大小、样本临床注释字段等更详细的信息。

【采集与来源】

数据采集自海德堡神经肿瘤中心,样本为 380 例胶质母细胞瘤患者的 FFPE 或 KRYO 组织。这些组织通过 Illumina 450k/EPIC 甲基化阵列进行分析。数据集的来源站为 ebi.ac.uk,数据集英文名中包含 PRJNA507175 标识以及 HD collective 集合名称。关于样本采集时间、采集地点、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于胶质母细胞瘤甲基化分型研究,尤其是涉及 RTK I、RTK II 或 mesenchymal 分类的样本分析。由于研究主题涉及老年 MGMT 启动子甲基化恶性星形细胞瘤与替莫唑胺的相关性,该数据也可用于探讨 RTK I 甲基化组之外病例的甲基化特征。此外,该数据集可用于脑肿瘤甲基化数据的二次分析、分类器验证或与其他甲基化数据集的整合研究。关于具体的分析软件、统计方法或临床终点,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 Illumina 450k/EPIC 阵列甲基化文件形式提供,使用者可根据甲基化分类器判定结果筛选 RTK I、RTK II 或 mesenchymal 样本。由于数据仅包含上述三类样本,使用时应避免将其推广至其他甲基化分类。关于数据下载方式、预处理流程、归一化方法或分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含甲基化分类器判定为 RTK I、RTK II 或 mesenchymal 的样本,因此不涵盖其他甲基化分类的胶质母细胞瘤病例。样本类型为 FFPE 或 KRYO 组织,可能涉及不同保存方式带来的技术差异。数据集样本量为 380 例,均来自海德堡神经肿瘤中心。关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应或验证结果,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,数据集英文名中包含 PRJNA507175 标识。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制或数据访问政策,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA507175

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据包含来自海德堡神经肿瘤中心380例胶质母细胞瘤患者的Illumina 450k/EPIC阵列甲基化文件。总体设计:采用Illumina 450k/EPIC甲基化阵列对380例胶质母细胞瘤患者的FFPE或KRYO组织进行分析。请注意,该数据集仅包含甲基化分类器判定为RTK I、RTK II或间充质型的样本。

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