PRJNA506921：替莫唑胺对MGMT启动子甲基化且非RTK I甲基化组老年恶性星形细胞瘤患者的适用性
该数据包含来自NOA-08研究104例患者的Illumina 450k/EPIC array甲基化文件，该研究在老年胶质母细胞瘤患者中比较了单用替莫唑胺与放疗
基本信息
资源简介
PRJNA506921：替莫唑胺对MGMT启动子甲基化且非RTK I甲基化组老年恶性星形细胞瘤患者的适用性
PRJNA506921 数据集收录了来自 NOA-08 研究的 Illumina 450k/EPIC array 甲基化文件，样本覆盖 104 例患者。NOA-08 研究针对老年胶质母细胞瘤患者，比较了单用替莫唑胺与放疗两种治疗策略。该数据集的核心价值在于以甲基化谱刻画这批患者肿瘤的分子特征，并围绕 MGMT 启动子甲基化状态以及 RTK I 甲基化分组之外的恶性星形细胞瘤，探讨替莫唑胺治疗的相关性。数据集归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向，来源站为 ebi.ac.uk，适合关注脑肿瘤分子分型、DNA 甲基化标志物及老年胶质母细胞瘤治疗相关研究的人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集所依托的 NOA-08 研究是一项在老年胶质母细胞瘤患者中开展的临床研究，其核心比较对象为单用替莫唑胺与放疗。研究共纳入 373 例患者，而本数据集聚焦于其中可获得组织用于生物标志物分析的部分。数据集标题指向的主题是：在 RTK I 甲基化分组之外的 MGMT 启动子甲基化恶性星形细胞瘤老年患者中，替莫唑胺的相关性。这一背景决定了该数据集并非单纯的甲基化谱集合，而是与特定临床问题、特定分子亚群和特定治疗决策紧密关联的研究资源。
【数据内容】
数据内容为 Illumina 450k/EPIC array 甲基化文件，来自 104 例患者。样本类型为 PPFE 组织，用于刻画这些患者肿瘤的甲基化谱。数据覆盖的分子检测平台包括 450k 与 EPIC 两种 array。除上述信息外，源站未提供关于文件数量、数据体积、具体样本分组明细、临床变量字段或甲基化位点注释的进一步说明。
【采集与来源】
样本来源于 NOA-08 研究。该研究共纳入 373 例患者，其中 104 例具备可用于生物标志物分析的组织，并最终以 PPFE 组织完成甲基化谱表征。数据来源站为 ebi.ac.uk。关于样本采集时间、采集中心、伦理审批信息以及具体处理流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕老年胶质母细胞瘤的甲基化研究，尤其是与 MGMT 启动子甲基化状态、RTK I 甲基化分组以及替莫唑胺治疗相关性有关的分析场景。由于数据以 450k/EPIC array 甲基化文件形式提供，可用于肿瘤甲基化谱的分子分型探索、生物标志物相关研究，以及与该临床研究背景相匹配的回顾性分析。关于是否适用于其他癌种、其他治疗场景或其他平台验证，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 Illumina 450k/EPIC array 甲基化文件形式提供，使用者可依据甲基化 array 数据的常规处理方式进行分析。关于具体下载地址、文件组织方式、预处理步骤、归一化方法、配套临床数据获取途径以及分析工具推荐，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集样本量为 104 例，来源于 NOA-08 研究中具备生物标志物分析组织的患者，而非全部 373 例入组患者。数据基于 PPFE 组织的 450k/EPIC array 甲基化文件。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应信息、样本排除标准以及平台间差异的处理方式，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制以及数据访问权限，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA506921
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据包含来自NOA-08研究的104名患者的Illumina 450k/EPIC阵列甲基化文件，该研究对比了老年胶质母细胞瘤患者单独使用替莫唑胺与放疗的效果。总体设计：在NOA-08研究纳入的373名患者中，有104名患者提供了可用于生物标志物分析的组织。采用PPFE组织通过450k/EPIC阵列来表征这些患者肿瘤的甲基化谱型。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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