PRJNA275391：人少年毛细胞型星形细胞瘤
低级别肿瘤微环境中的微胶质细胞已被证明允许并支持肿瘤生长，但这些微胶质细胞的表达谱尚不清楚。为检查微胶质细胞在少年毛细胞型星形细胞瘤中的作用，从冷冻保存的肿瘤手术切除标本和正常脑组织中通过流式分选获得巨噬细胞
基本信息
资源简介
PRJNA275391：人少年毛细胞型星形细胞瘤
PRJNA275391: Human junior pilocytic astrocytoma 是一个聚焦于少年毛细胞型星形细胞瘤微环境中巨噬细胞/微胶质细胞表达特征的数据集，归属于肿瘤 / 脑肿瘤分类，来源站为 ebi.ac.uk。该数据集的核心研究背景在于，低级别肿瘤微环境中的微胶质细胞已被证明允许并支持肿瘤生长，但这些微胶质细胞的表达谱尚不清楚。为检查微胶质细胞在少年毛细胞型星形细胞瘤中的作用，研究从冷冻保存的肿瘤手术切除标本和正常脑组织中通过流式分选获得巨噬细胞，并对肿瘤相关微胶质细胞的上调标志物进行验证，同时与小鼠肿瘤相关微胶质细胞进行比较。整体设计围绕少年毛细胞型星形细胞瘤巨噬细胞的流式分选、胶质瘤相关微胶质细胞上调基因的验证及进一步检查展开。
【数据集背景】
低级别肿瘤微环境中的微胶质细胞已被证明允许并支持肿瘤生长，但这些微胶质细胞的表达谱尚不清楚。少年毛细胞型星形细胞瘤属于低级别肿瘤范畴，其微环境中的巨噬细胞/微胶质细胞如何参与肿瘤生长支持，是本研究关注的核心问题。为回答这一问题，研究需要获取肿瘤组织与正常脑组织中的巨噬细胞，并对其表达特征进行比较分析。该数据集即围绕这一研究目标产生，旨在通过流式分选获得目标细胞群体，进而检查微胶质细胞在少年毛细胞型星形细胞瘤中的作用。
【数据内容】
该数据集涉及从冷冻保存的肿瘤手术切除标本和正常脑组织中通过流式分选获得的巨噬细胞。研究对肿瘤相关微胶质细胞的上调标志物进行了验证，并与小鼠肿瘤相关微胶质细胞进行了比较。整体设计包括：对少年毛细胞型星形细胞瘤巨噬细胞进行流式分选；对胶质瘤相关微胶质细胞的上调基因进行验证并进一步检查。数据集英文名为 PRJNA275391: Human junior pilocytic astrocytoma，本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤。除上述内容外，源站未提供更具体的样本数量、测序平台、数据文件类型或基因列表等信息。
【采集与来源】
数据来源站为 ebi.ac.uk。样本来源包括冷冻保存的肿瘤手术切除标本和正常脑组织。研究通过流式分选从这些组织中获取巨噬细胞。研究对象为少年毛细胞型星形细胞瘤，属于低级别肿瘤。研究还将肿瘤相关微胶质细胞的上调标志物与小鼠肿瘤相关微胶质细胞进行了比较。除上述来源与采集方式外，源站未提供具体的采集时间、地点、伦理审批信息或样本处理细节。
【适用场景】
该数据集适用于研究低级别肿瘤微环境中微胶质细胞/巨噬细胞的表达特征，尤其是少年毛细胞型星形细胞瘤中肿瘤相关微胶质细胞的作用。可用于分析肿瘤相关微胶质细胞的上调标志物，并支持与小鼠肿瘤相关微胶质细胞的比较研究。也可用于探索微胶质细胞在允许和支持肿瘤生长过程中的潜在表达变化。由于数据集涉及肿瘤与正常脑组织的对比，还可用于比较肿瘤微环境与正常组织中巨噬细胞/微胶质细胞的表达差异。除上述场景外，源站未提供其他具体适用场景。
【使用方法】
该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取。研究设计中涉及对冷冻保存的肿瘤手术切除标本和正常脑组织进行流式分选以获得巨噬细胞，并对肿瘤相关微胶质细胞的上调标志物进行验证和进一步检查。使用者可根据源站提供的数据组织方式，结合自身研究目的进行表达谱分析、标志物验证或跨物种比较。由于源站未提供具体的数据格式、下载方式、分析流程或软件工具，相关操作需依据源站实际提供的信息进行。除上述内容外，源站未提供更详细的使用方法说明。
【质量与限制】
该数据集基于冷冻保存的肿瘤手术切除标本和正常脑组织，通过流式分选获得巨噬细胞，并对肿瘤相关微胶质细胞的上调标志物进行验证。研究还将结果与小鼠肿瘤相关微胶质细胞进行比较。然而，源站未提供样本量、测序深度、数据完整性、批次效应、质量控制指标或验证实验的详细结果。因此，使用者在解释数据时需注意这些未提供的信息可能带来的限制。此外，源站未提供关于数据可重复性、偏差来源或技术局限的具体说明。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者如需引用或使用该数据集，应直接访问来源站 ebi.ac.uk 查询相关说明。除上述内容外，源站未提供其他关于引用格式、许可条款或使用限制的信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA275391
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
低级别肿瘤微环境中的小胶质细胞已被证明允许并支持肿瘤生长，但这些小胶质细胞的表达谱尚不清楚。为了研究小胶质细胞在青少年毛细胞型星形细胞瘤中的作用，从冷冻保存的肿瘤手术切除标本和正常脑组织中通过流式分选获取了巨噬细胞。肿瘤相关小胶质细胞的上调标志物得到了验证，并与小鼠肿瘤相关小胶质细胞进行了比较。总体设计：对青少年毛细胞型星形细胞瘤巨噬细胞进行了流式分选。胶质瘤相关小胶质细胞的上调基因得到了验证并进一步研究。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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