PRJNA1481188：ANXA1在胶质母细胞瘤中的新功能
实验设置ANXA1靶向siRNA与阴性对照siRNA两组，每组三个生物学重复。数据用于刻画ANXA1缺失引起的转录组变化，识别与胶质瘤细胞增殖、迁移和肿瘤进展相关的下游基因与通路，并支持将ANXA1作为胶质母细胞瘤潜在预后生物标志物和功能调控因子的研究（来源 ncbi.nlm.nih.gov）
基本信息
资源简介
PRJNA1481188：ANXA1在胶质母细胞瘤中的新功能
PRJNA1481188 是一个聚焦胶质母细胞瘤分子机制研究的转录组数据集，全称为“The new function of ANXA1 in glioblastoma”。该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，属于肿瘤 / 脑肿瘤分类，主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads）。其核心实验设计是在人胶质瘤 U87 细胞中，通过 siRNA 介导的 ANXA1 敲低，并与非靶向阴性对照 siRNA 进行比较，每组设置三个生物学重复。数据旨在刻画 ANXA1 缺失所引发的转录组变化，识别与胶质瘤细胞增殖、迁移及肿瘤进展相关的下游基因和通路，并为将 ANXA1 作为胶质母细胞瘤潜在预后生物标志物和功能调控因子的研究提供支持。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是中枢神经系统中极具侵袭性的肿瘤类型，寻找可靠的预后标志物和功能调控因子一直是该领域的研究重点。ANXA1（膜联蛋白 A1）在该数据集中被作为研究对象，旨在探索其在胶质母细胞瘤中的新功能。该数据集通过体外细胞实验，对 ANXA1 表达进行干预，以观察其对转录组层面的影响，从而为理解 ANXA1 在胶质瘤细胞增殖、迁移和肿瘤进展中的角色提供数据基础。该研究支持将 ANXA1 视为潜在的预后生物标志物和功能调控因子。
【数据内容】
该 BioProject 包含由 U87 人胶质瘤细胞生成的 bulk RNA 测序数据。实验分为两组：一组细胞转染 ANXA1 靶向 siRNA，另一组转染非靶向阴性对照 siRNA。每组均设置三个生物学重复。数据内容属于原始序列读段，可用于后续的转录组分析，以表征 ANXA1 敲低后引起的基因表达变化，并帮助识别与胶质瘤细胞增殖、迁移和肿瘤进展相关的下游基因与通路。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的条目。样本材料为人胶质瘤 U87 细胞，经过 siRNA 转染处理。实验设置包括 ANXA1 靶向 siRNA 组和阴性对照 siRNA 组，每组三个生物学重复。测序类型为 bulk RNA 测序，生成的数据以原始序列读段形式呈现。源站描述中未提供具体的测序平台、建库方法、测序深度、读长等详细技术参数。
【适用场景】
该数据集适用于研究 ANXA1 在胶质母细胞瘤中的功能，尤其是通过转录组层面分析 ANXA1 缺失对基因表达的影响。具体适用场景包括：识别 ANXA1 敲低后差异表达的基因和受影响的信号通路；探索与胶质瘤细胞增殖、迁移和肿瘤进展相关的下游分子机制；支持将 ANXA1 作为胶质母细胞瘤潜在预后生物标志物和功能调控因子的研究。此外，该数据也可用于与其它胶质瘤转录组数据进行比较分析，或作为相关体外实验的参考数据集。
【使用方法】
使用者可基于该 BioProject 提供的原始序列读段，开展标准的 RNA 测序数据分析流程。通常包括序列质量控制、比对到参考基因组、表达定量、差异表达分析以及功能富集分析等步骤。分析时需注意实验设计中的两组比较：ANXA1 靶向 siRNA 组与阴性对照 siRNA 组，并利用每组三个生物学重复进行统计检验。通过差异表达和通路分析，可进一步挖掘 ANXA1 缺失引起的转录组变化及其与胶质瘤细胞增殖、迁移和肿瘤进展的关联。源站未提供具体的分析流程或推荐工具。
【质量与限制】
该数据集设置了三个生物学重复，有助于提高统计分析的可靠性。数据为 bulk RNA 测序，能够反映细胞群体的平均转录组变化，但无法解析单细胞水平的异质性。实验仅在 U87 人胶质瘤细胞系中进行，未涉及其他细胞系、动物模型或临床样本，因此结论的外推需谨慎。源站未提供测序质量评分、比对率、覆盖度等具体质量控制指标，也未说明是否存在批次效应或其它技术偏差。此外，该数据集仅针对 ANXA1 敲低后的转录组变化，不包含蛋白质水平或功能验证数据。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 条目，编号为 PRJNA1481188。关于引用方式、许可条款、数据使用限制等信息，源站未提供。使用者应直接访问 NCBI BioProject 页面获取最新的引用要求和许可说明。
下载信息
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无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1481188
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该BioProject包含在siRNA介导的ANXA1敲低后，从U87人胶质瘤细胞中生成的大量RNA测序数据。U87细胞被转染了靶向ANXA1的siRNA或非靶向阴性对照siRNA，每组有三个生物学重复。该数据集旨在表征由ANXA1耗竭引起的转录组变化，并识别与胶质瘤细胞增殖、迁移和肿瘤进展相关的下游基因和通路。这些数据支持了一项关于ANXA1作为胶质母细胞瘤潜在预后生物标志物和功能调节因子的研究。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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