U87胶质瘤细胞转染shScramble或DNAJC10-shRNA的全转录组测序
该数据集为人类胶质瘤U87细胞在两种转染处理下的全转录组测序数据，包括shScramble对照组和靶向DNAJC10的DNAJC10-shRNA实验组
基本信息
资源简介
U87胶质瘤细胞转染shScramble或DNAJC10-shRNA的全转录组测序
PRJNA1306552 数据集收录了人类胶质瘤 U87 细胞在两种不同转染处理条件下的全转录组测序数据，处理组分别为 shScramble 对照组与靶向 DNAJC10 的 DNAJC10-shRNA 实验组。该测序工作的目的在于考察 DNAJC10 敲低对胶质瘤 U87 细胞基因表达谱的影响，进而识别受 DNAJC10 缺失影响的差异表达基因及相关分子通路。数据集属于肿瘤/脑肿瘤分类，主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），来源为 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）。整体而言，该数据集为研究 DNAJC10 在胶质瘤细胞中的表达调控作用提供了转录组层面的原始测序素材，适合用于差异表达分析与通路层面的后续挖掘。
【数据集背景】
胶质瘤是中枢神经系统常见的恶性肿瘤，U87 细胞是胶质瘤研究中广泛使用的细胞模型。DNAJC10 作为研究对象，其在该细胞模型中的功能尚需通过表达干预实验加以解析。该数据集正是围绕这一研究需求产生：通过对 U87 细胞分别转染 shScramble 与 DNAJC10-shRNA，构建对照与敲低两种状态，并借助全转录组测序比较二者的基因表达差异，从而为理解 DNAJC10 在胶质瘤细胞中的分子作用提供数据基础。源站描述明确指出，该测序的目的是研究 DNAJC10 敲低对胶质瘤 U87 细胞基因表达谱的影响，识别差异表达基因及受 DNAJC10 缺失影响的相关分子通路。
【数据内容】
该数据集的内容为人类胶质瘤 U87 细胞的全转录组测序数据，涵盖两种转染处理：shScramble 对照组和靶向 DNAJC10 的 DNAJC10-shRNA 实验组。数据以原始序列读段的形式组织，主题标签即为 Raw sequence reads。数据涉及的是转录组层面的序列信息，可用于后续的基因表达定量与差异比较。除上述两种处理分组与全转录组测序这一数据类型的说明外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读段长度、数据量等更细化的描述。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），数据集编号为 PRJNA1306552。生物学材料为人类胶质瘤 U87 细胞，经过 shScramble 或 DNAJC10-shRNA 转染处理后再进行全转录组测序。关于具体的细胞培养条件、转染试剂、测序建库流程与测序仪器等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于以下研究方向：比较 DNAJC10 敲低与对照条件下胶质瘤 U87 细胞的基因表达谱差异，筛选差异表达基因；围绕 DNAJC10 缺失所影响的分子通路开展通路富集与功能推断；作为胶质瘤细胞转录组研究的原始数据资源，用于方法复现或与其他胶质瘤转录组数据的对照分析。其原始序列读段的属性也使其适合作为重新定量与重新分析的输入材料。
【使用方法】
使用时可依据 shScramble 与 DNAJC10-shRNA 两种处理分组对原始序列读段进行整理，先完成读段质控与比对，再进行表达定量与差异表达分析，进而开展通路层面的解读。由于数据集提供的是原始序列读段，使用者的分析结果在很大程度上取决于所选择的比对参考、定量工具与差异分析参数。关于具体的分析流程与推荐参数，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为原始序列读段，未提供经过处理的表达矩阵或差异分析结果，使用者需自行完成从原始读段到表达定量的完整流程。数据仅涉及 U87 这一种细胞系以及两种转染处理，结论的外推范围受此限制。关于测序深度、重复数量、批次信息与质控指标等，源站未提供，因此难以在数据层面直接评估其统计效力与可重复性。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，数据集编号为 PRJNA1306552。关于具体的引用文献、作者信息与数据使用许可条款，源站未提供。使用与再分发时应遵循 NCBI 的相关数据使用政策。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1306552
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集包含人胶质瘤U87细胞在两种不同转染处理下的全转录组测序数据：shScramble（对照组）和DNAJC10-shRNA（靶向DNAJC10的实验组）。本次测序旨在探究DNAJC10敲低对胶质瘤U87细胞基因表达谱的影响，以识别胶质瘤细胞中受DNAJC10缺失影响的差异表达基因及相关分子通路。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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