STING激动剂敏感与耐药胶质母细胞瘤细胞转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1304729

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目包含同基因H4胶质母细胞瘤（GBM）模型的RNA-seq数据，用于研究对持续性STING激活的适应。共对三种条件进行了生物学三重复分析：(i) 用溶剂对照（DMSO，6小时）处理的亲本H4细胞，(ii) 用STING激动剂diABZI（1 μM，6小时）处理的亲本H4细胞，以及(iii) 通过持续选择（diABZI浓度递增至20 μM，持续>2个月）产生的diABZI耐药亚系（H4-R），并在无药物条件下收获。文库采用poly(A)选择法制备，并在Illumina NovaSeq 6000平台上测序（双端150 bp）。该数据集可用于分析急性STING反应及肿瘤内在耐药机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。