OPAL成像空间蛋白质组学处理单细胞数据用于胶质母细胞瘤LMTK3表征
该数据集包含通过OPAL分析人胶质母细胞瘤标本生成的处理后对象级定量数据。数据集包括使用Visiopharm图像分析生成的空间坐标和标志物强度测量值，并支持相关手稿图2和图4中呈现的空间分析
基本信息
资源简介
OPAL成像空间蛋白质组学处理单细胞数据用于胶质母细胞瘤LMTK3表征
该数据集为英文命名的影像空间蛋白质组学处理后单细胞数据，聚焦于胶质母细胞瘤中 LMTK3 的表征研究。数据来源于对人胶质母细胞瘤标本开展的 OPAL 分析，属于处理后对象级定量数据，包含空间坐标与标志物强度测量值，这些测量值由 Visiopharm 图像分析生成。该数据集在站内归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向，来源站为 doi.org，作者为 Heng, Liang，所属机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年，采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可。整体而言，该数据集面向肿瘤组织空间层面的蛋白质标志物定量表征，可为相关手稿中图 2 与图 4 所呈现的空间分析提供数据支撑。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是脑肿瘤研究中的重要对象，对其组织标本进行空间层面的蛋白质标志物表征，有助于在细胞与组织结构的空间语境下观察标志物的分布特征。该数据集围绕 LMTK3 在胶质母细胞瘤中的表征而建立，依托 OPAL 分析流程对人胶质母细胞瘤标本进行检测，并将图像分析结果整理为处理后对象级定量数据。数据集所属分类为肿瘤 / 脑肿瘤，来源站为 doi.org，作者为 Heng, Liang，机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年。其建立目的在于支撑相关手稿中图 2 和图 4 所呈现的空间分析，使基于图像的空间蛋白质组学测量结果能够以对象级定量数据的形式被进一步使用。
【数据内容】
该数据集包含通过 OPAL 分析人胶质母细胞瘤标本生成的处理后对象级定量数据。具体而言，数据包括使用 Visiopharm 图像分析生成的空间坐标和标志物强度测量值。空间坐标记录了对象在组织图像中的位置信息，标志物强度测量值则对应各对象在 OPAL 分析中所获得的标志物信号强度。数据以对象级为组织粒度，属于经过处理后的定量结果，而非原始图像。数据集支持相关手稿图 2 和图 4 中呈现的空间分析，说明其内容组织与这两部分空间分析的需求相对应。除上述内容外，源站未提供关于数据表结构、字段数量、对象数量、标志物种类及文件组织方式的进一步说明。
【采集与来源】
数据来源于人胶质母细胞瘤标本的 OPAL 分析。OPAL 分析用于对组织标本中的标志物进行标记与成像检测，随后通过 Visiopharm 图像分析生成对象级的空间坐标与标志物强度测量值。数据集来源站为 doi.org，作者为 Heng, Liang，所属机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年。数据为处理后对象级定量数据，表明其已经过图像分析流程的处理，形成可供空间分析使用的定量记录。关于标本采集的具体流程、样本数量、成像设备参数、OPAL 面板所包含的标志物清单以及图像分析的具体设置，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕胶质母细胞瘤组织空间蛋白质组学的分析场景，尤其是需要在对象级定量数据基础上考察标志物强度与空间坐标关系的空间分析。由于其内容直接支撑相关手稿图 2 和图 4 中呈现的空间分析，可用于复现或延伸这些分析思路，例如在组织空间结构中观察标志物强度的分布特征。数据集聚焦 LMTK3 在胶质母细胞瘤中的表征，因此也适合作为该主题下空间层面定量观察的数据基础。关于该数据集在其他研究场景中的适用性，源站未提供更多说明。
【使用方法】
使用该数据集时，可基于其提供的对象级空间坐标与标志物强度测量值开展空间分析，并与相关手稿图 2 和图 4 中呈现的分析相对应。由于数据为处理后对象级定量数据，使用者可直接在对象层面组织空间位置与标志物强度信息，用于考察组织内不同位置上标志物强度的分布与关系。数据由 Visiopharm 图像分析生成，使用时应结合这一图像分析背景理解坐标与强度测量值的含义。关于具体的文件格式、读取方式、字段定义及分析代码，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为处理后对象级定量数据，其空间坐标与标志物强度测量值由 Visiopharm 图像分析生成，数据内容与相关手稿图 2 和图 4 的空间分析相对应。由于数据已经过处理，使用者获得的是对象级定量结果而非原始图像，因此无法直接据此重新进行图像层面的处理或调整图像分析参数。数据集仅覆盖人胶质母细胞瘤标本的 OPAL 分析结果，关于样本量、标志物覆盖范围、批次信息、质控指标及数据完整性评估，源站未提供。使用时应留意其作为处理后数据的性质，并在空间分析中结合对象级测量的特点加以解读。
【引用与许可】
该数据集作者为 Heng, Liang，所属机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年，来源站为 doi.org。数据集采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可，使用与传播时应遵循该许可的要求，并按要求进行署名。关于具体的引用格式、DOI 标识及署名细节，源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.22074078
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含通过对人胶质母细胞瘤标本进行OPAL分析所生成的处理后对象级定量数据。数据集包括使用Visiopharm图像分析生成的空间坐标和标志物强度测量值，并支持相关手稿图2和图4中呈现的空间分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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