IMC 脑肿瘤数据集（Karimi 等）

资源简介

IMC 脑肿瘤数据集（Karimi 等）

IMC Brain Tumors dataset (Karimi et al.) 是一个聚焦脑肿瘤微环境的成像质谱流式（IMC）数据集，由 University of North Carolina Chapel Hill 提供，发布于 Zenodo，采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可。该数据集刻画了 139 例原发性胶质母细胞瘤（GBM）患者和 46 例转移性脑肿瘤（BrM）个体的脑肿瘤微环境，覆盖肿瘤核心、侵袭边缘及邻近非恶性组织等区域。由于部分患者贡献了多个空间区域样本，数据集最终包含 270 个 GBM 样本和 123 个 BrM 样本。在分类实验中，该数据集的目标是区分胶质母细胞瘤患者与转移性脑肿瘤患者，为脑肿瘤微环境研究和基于 IMC 的分类分析提供资源。

【数据集背景】

脑肿瘤，尤其是胶质母细胞瘤与转移性脑肿瘤，其微环境具有高度异质性，不同空间区域和不同患者来源的样本在细胞组成与蛋白表达上可能存在差异。该数据集以 IMC 技术为基础，针对脑肿瘤微环境进行刻画，覆盖原发性胶质母细胞瘤和转移性脑肿瘤两类样本。其设计目的之一是在分类实验中区分胶质母细胞瘤患者与转移性脑肿瘤患者，因此既可用于脑肿瘤微环境的描述性研究，也可用于分类方法在 IMC 数据上的验证与比较。

【数据内容】

数据集涉及 139 例原发性胶质母细胞瘤（GBM）患者和 46 例转移性脑肿瘤（BrM）个体。每个样本考虑 18 个常见通道，其中包含 17 个蛋白标记物，这些通道在各样本间共享。样本取自脑肿瘤微环境的不同区域，包括肿瘤核心、侵袭边缘以及邻近非恶性组织区域。由于部分患者贡献了多个空间区域，最终样本数量多于患者数量，共包含 270 个 GBM 样本和 123 个 BrM 样本。分类实验的目标是将胶质母细胞瘤患者与转移性脑肿瘤患者区分开来。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 doi.org，作者为 University of North Carolina Chapel Hill，机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年。样本覆盖脑肿瘤微环境的多个空间区域，包括肿瘤核心、侵袭边缘和邻近非恶性组织。关于具体的样本采集流程、仪器参数、染色步骤、成像条件或数据处理细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于脑肿瘤微环境研究，尤其是针对原发性胶质母细胞瘤与转移性脑肿瘤的比较分析。由于每个样本包含 18 个常见通道（17 个蛋白标记物），可用于观察不同空间区域中蛋白标记物的表达与分布。分类实验的设计目标是将胶质母细胞瘤患者与转移性脑肿瘤患者区分开，因此该数据集也可用于分类任务的方法开发与评估。此外，由于样本覆盖肿瘤核心、侵袭边缘和邻近非恶性组织，适合开展与空间区域相关的微环境分析。

【使用方法】

该数据集以 IMC 脑肿瘤样本为基础，包含 GBM 与 BrM 两类样本，并覆盖多个空间区域。使用时可根据研究目的选择患者层级或样本层级进行分析；若关注患者分类，可利用分类实验设定区分胶质母细胞瘤与转移性脑肿瘤。由于部分患者贡献多个空间区域样本，分析时需注意样本与患者之间的对应关系，避免将同一患者的不同区域样本简单视为完全独立。关于具体的数据加载方式、文件格式、预处理流程或代码示例，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集覆盖 139 例 GBM 患者和 46 例 BrM 患者，并包含 270 个 GBM 样本和 123 个 BrM 样本，样本来自肿瘤核心、侵袭边缘和邻近非恶性组织。每个样本考虑 18 个常见通道，其中 17 个为蛋白标记物。由于部分患者贡献多个空间区域，样本数量与患者数量不一致，分析时需考虑这种嵌套结构。关于数据质量评估、批次效应、缺失值、噪声水平或技术验证等信息，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集英文名为 IMC Brain Tumors dataset (Karimi et al.)，作者为 University of North Carolina Chapel Hill，机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年，来源站为 doi.org。许可为 Creative Commons Attribution 4.0 International。使用时应遵循该许可要求进行署名。关于具体引用格式、DOI 编号或作者列表的完整信息，源站未提供。