自身免疫性脑炎及相关疾病中的HLA分析：第二部分

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04823728

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数据说明

疾病：自身免疫性脑炎、副肿瘤性神经综合征。自身免疫性脑炎（AE）的特征是亚急性起病的记忆缺陷、精神状态改变或精神症状，常伴有癫痫发作、脑脊液炎症，在明显累及边缘系统的情况下，还有典型的磁共振成像表现。在AE中可检测到多种自身抗体（Abs），尽管其检测并非确立诊断所必需。这些抗体主要识别中枢神经系统中不同的突触和细胞表面蛋白，并被认为具有致病性，因为它们会改变其抗原的正常位置或功能。副肿瘤性神经综合征（PNS）是免疫介导的、癌症的远隔并发症。其临床表现高度多样，从中枢神经系统疾病（边缘性脑炎、小脑性共济失调）到周围神经病和神经肌肉接头疾病。

与PNS相关的有两种不同的抗体：第一类称为肿瘤神经抗体，其识别细胞内抗原，被认为不具有致病性；第二类则靶向突触和细胞表面抗原，这些抗原与某些非副肿瘤性自身免疫性脑炎共有。大多数自身免疫性脑炎的免疫反应主要触发因素尚不清楚。除获得性易感性如单纯疱疹病毒性脑炎外，遗传倾向在自身免疫性脑炎的发病机制中也可能起重要作用。人类白细胞抗原是自身免疫性疾病最常关联的遗传因素，这归因于其遗传复杂性和在适应性免疫反应中的关键作用。其他研究者及我们已描述了与三种不同类型自身免疫性脑炎相关的HLA单倍型：抗富亮氨酸胶质瘤失活1蛋白、抗接触蛋白相关蛋白样2和抗谷氨酸脱羧酶。然而，许多其他自身免疫性脑炎的遗传倾向尚未被研究。癌症被认为是引发免疫反应导致PNS发展的触发因素，正如神经抗原

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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