FK2D 肿瘤生长仿真数据集

每个病例模拟肿瘤在参数化 2D 脑横截面上随时间生长,从单一初始病灶逐步侵入白质实质。数据集提供肿瘤细胞密度、分割掩膜和生长轨迹的精确 ground truth

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基因组图像分割GliomaBrain NeoplasmsPhantoms, ImagingComputer SimulationModels, BiologicalImage Processing, Computer-Assisted
FK2D Tumor Growth Phantom Dataset

基本信息

模态
基因组
大小
0.013398302 GB
任务类型
图像分割
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

FK2D 肿瘤生长仿真数据集

FK2D Tumor Growth Phantom Dataset

FK2D Tumor Growth Phantom Dataset 是一个合成数据集,通过数值求解 Fisher–Kolmogorov(FK)反应扩散偏微分方程生成模拟的 2D 胶质瘤生长病例。每个病例模拟肿瘤在参数化 2D 脑横截面上随时间生长,从单一初始病灶逐步侵入白质实质。数据集提供肿瘤细胞密度、分割掩膜和生长轨迹的精确 ground truth。当前 Zenodo 仓库提供的是 20 例免费试用样本,仅用于评估质量与兼容性,完整 1,000 例数据集需另行购买。该数据可用于脑肿瘤生长建模、图像分割与计算机辅助图像处理等研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 Internat。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):⚠️ 重要提示:这是一个免费试用样本。请注意,本 Zenodo 仓库中提供的文件代表免费试用样本(20 例),仅用于评估质量和兼容性。完整的 1,000 例数据集可在此处访问和购买: FK2D Tumor Growth Phantom Dataset(样本)1. 产品概述 FK2D Phantom Dataset 是一个合成集合,由数值求解 Fisher–Kolmogorov(FK)反应扩散偏微分方程(PDE)生成的模拟 2D 胶质瘤生长病例组成。每个病例模拟肿瘤在参数化的 2D 脑横截面上随时间生长——从单一初始病灶到逐步侵入白质实质。该数据集为肿瘤细胞密度、分割掩膜和生长轨迹提供精确的 ground truth,wi

【主题与分类】

主题标签:Glioma、Brain Neoplasms、Phantoms, Imaging、Computer Simulation、Models, Biological、Image Processing, Computer-Assisted。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22755247

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22755247

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 13.4 MB。

数据说明

⚠️ 重要提示:此为免费试用样本 请注意,本 Zenodo 仓库中提供的文件为免费试用样本(20 例),仅供评估质量和兼容性之用。完整的 1,000 例数据集可在此处访问和购买:https://sentineldata.com.ua/dataset/fk2d-tumor-growth-phantom-dataset FK2D 肿瘤生长体模数据集(样本) 1. 产品概述 FK2D 体模数据集是通过数值求解 Fisher–Kolmogorov(FK)反应-扩散偏微分方程(PDE)生成的模拟 2D 胶质瘤生长病例的合成集合。每个病例模拟肿瘤在参数化 2D 脑横截面中随时间生长——从单个起始病灶到逐步侵袭白质实质。该数据集为肿瘤细胞密度、分割掩膜和生长轨迹提供了精确的真值,无需专门的医学影像软件。它是 100% 合成的,这意味着零 HIPAA/GDPR 暴露风险,且不涉及任何真实患者数据。 2.

示例内容(Zenodo 下载)该 Zenodo 仓库包含完整数据集的代表性样本:20 个独特病例(8 个低级别胶质瘤 [LGG] + 12 个高级别胶质瘤 [HGG]),每个病例 8 个均匀分布的时间点(从 $t = 0$ 到模拟结束),格式与完整数据集相同:灰度 PNG + float32 NumPy + CSV 元数据。(完整商业数据集包含 1,000 个病例——500 个 LGG 和 500 个 HGG——采用对数均匀参数采样,共生成 8,000 个快照)。3. 技术规格 网格/分辨率:256 x 256 像素,$1.0\text{ mm/pixel}$(FOV $256 \times 256\text{ mm}$)输出格式:PNG(uint8)、NPY(float32)、CSV 真值类型:4 种类型(密度场 $u(x,y,t)$、分割掩膜、生长轨迹、生物学参数)噪声变体:每个时间点的干净 + 高斯噪声 PNG(SNR = 20)体模几何 脑边界:椭圆 $95 \times 70\text{ px}$($190 \times 140\text{ mm}$ 外边界

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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