感染人巨细胞病毒Towne株72小时后的原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞RNAseq
该数据集来自EBI Expression Atlas的差异表达实验，物种为Homo sapiens，对原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞在感染人巨细胞病毒（CMV）Towne株72小时后进行RNAseq
基本信息
资源简介
感染人巨细胞病毒Towne株72小时后的原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞RNAseq
E-MTAB-7613 是一项收录于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集，物种为 Homo sapiens，聚焦肿瘤与脑肿瘤方向。该实验对原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞在感染人巨细胞病毒（CMV）Towne 株 72 小时后开展 RNAseq 检测，用于观察感染前后基因表达层面的差异变化。数据集以 Differential 为主题标签，属于表达谱差异分析类资源，可通过 ebi.ac.uk 来源站获取，适合关注胶质母细胞瘤与病毒相互作用研究的人员参考使用。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是脑肿瘤研究中的重要对象，而原神经型（proneural）胶质母细胞瘤干细胞样细胞是研究该肿瘤生物学行为的常用体外模型。人巨细胞病毒（CMV）Towne 株是实验室研究中使用的病毒株之一。该数据集正是围绕这一组合设计：以原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞为对象，在感染 CMV Towne 株后 72 小时进行 RNAseq，从转录组层面记录感染带来的表达变化。数据集归入肿瘤 / 脑肿瘤分类，主题标签为 Differential，表明其核心用途是差异表达分析而非单纯的表达谱展示。
【数据内容】
数据集为 RNAseq 实验产生的表达数据，来源于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验条目。物种为 Homo sapiens。实验涉及的处理条件为感染人巨细胞病毒 Towne 株，时间点为感染后 72 小时，细胞类型为原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞。数据内容围绕感染组与对照条件之间的基因表达差异展开，可用于识别在该时间点上表达发生变化的基因。关于具体样本数量、测序平台、读长、基因注释版本、差异分析阈值与结果基因数目等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，是 EBI Expression Atlas 中的一项实验记录，实验编号为 E-MTAB-7613。Expression Atlas 对实验的类型标注为 Differential，物种标注为 Homo sapiens。数据集英文名称完整描述了实验体系：原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞在感染人巨细胞病毒 Towne 株 72 小时后的 RNAseq。关于样本采集地点、伦理审批信息、具体实验操作流程与测序服务提供方等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究 CMV 感染对原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞转录组的影响，可用于差异表达基因的筛选与验证、病毒—肿瘤相互作用假设的生成，以及与其他胶质母细胞瘤表达数据集的比较分析。由于主题标签为 Differential，其典型用途包括感染组与对照组之间的表达变化分析。关于该数据集是否适合特定临床或转化研究用途，源站未提供相应说明。
【使用方法】
使用者可通过 ebi.ac.uk 访问 EBI Expression Atlas 中的该实验条目，获取差异表达相关信息。分析时可围绕感染后 72 小时这一时间点，考察原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞在 CMV Towne 株感染条件下的表达变化。关于数据下载格式、处理流程、标准化方法及分析工具建议，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为单一实验条件下的 RNAseq 差异表达记录，时间点固定为感染后 72 小时，细胞模型为原神经型胶质母细胞瘤干细胞样细胞，结论外推需谨慎。关于样本量、重复数、测序深度、质控指标与统计显著性阈值等质量相关信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 EBI Expression Atlas，实验编号为 E-MTAB-7613，来源站为 ebi.ac.uk。关于具体的引用文献、作者列表与数据使用许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-7613
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. RNAseq of proneural glioblastoma stem-like cells 72 hours after infection with human cytomegalovirus (CMV) Towne strain
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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