使用超环面模型的胶质母细胞瘤扩散张量成像

目的:扩散张量成像(DTI)是一种强大的成像技术,已推动脑部病变诊断与预后以及肿瘤切除神经外科导航的改进。然而,传统张量建模在区分肿瘤浸润区域与瘤周水肿方面存在困难

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基因组分类胶质母细胞瘤扩散张量成像超环面模型脑肿瘤DTI肿瘤浸润瘤周水肿
Diffusion tensor imaging in patients with glioblastoma multiforme using the supertoroidal model

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

使用超环面模型的胶质母细胞瘤扩散张量成像

该数据集名为“Diffusion tensor imaging in patients with glioblastoma multiforme using the supertoroidal model”,属于肿瘤/脑肿瘤分类,来源站为search.dataone.org。其核心内容围绕扩散张量成像(DTI)在胶质母细胞瘤(GBM)表征中的应用展开。源站描述指出,DTI是一种强大的成像技术,已推动脑部病变诊断与预后以及肿瘤切除神经外科导航的改进。然而,传统张量建模在区分肿瘤浸润区域与瘤周水肿方面存在困难。为此,该数据集引入了超环面模型(supertoroidal model),通过增加表面亏格和连续环面形状来改进对GBM的表征。数据集包含18名GBM患者和18名正常受试者的DTI脑部数据,采集使用3T扫描仪,并应用了两种新的扩散张量不变量:用于评估扩散性的环面体积(TV)和用于评估各向异性的环面曲率(TC)。

【数据集背景】

胶质母细胞瘤(GBM)是脑肿瘤中具有高度侵袭性的类型,其精确诊断和手术切除对患者预后至关重要。扩散张量成像(DTI)作为一种无创成像技术,能够反映脑组织微观结构,在脑部病变诊断、预后评估以及神经外科导航中发挥重要作用。然而,传统扩散张量模型在区分肿瘤浸润区域与瘤周水肿时存在局限,这影响了肿瘤边界的准确界定。该数据集正是针对这一挑战,采用超环面模型来提升GBM的表征能力。超环面模型通过引入表面亏格的增加和连续环面形状,试图更精细地刻画扩散张量的复杂几何特征,从而为临床提供更可靠的影像学依据。

【数据内容】

该数据集包含DTI脑部影像数据,来自18名GBM患者和18名正常受试者。数据采集后,研究者应用了超环面模型,并计算了两个新的扩散张量不变量:环面体积(TV)用于评估扩散性,环面曲率(TC)用于评估各向异性。这些不变量旨在改进对GBM的表征,特别是区分肿瘤浸润区域与瘤周水肿。数据集的具体文件格式、图像分辨率、扫描参数、受试者年龄与性别分布、以及是否包含分割标注或临床元数据等信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据采集使用3T扫描仪,获取了18名GBM患者和18名正常受试者的DTI脑部数据集。来源站为search.dataone.org。关于扫描的具体序列参数(如b值、梯度方向数、重复时间、回波时间等)、采集中心、采集时间范围、伦理审批信息以及数据共享协议等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于脑肿瘤影像研究,特别是胶质母细胞瘤的扩散张量成像分析。潜在应用包括:评估超环面模型在区分肿瘤浸润区域与瘤周水肿中的效果;验证环面体积(TV)和环面曲率(TC)作为扩散张量不变量的价值;比较GBM患者与正常受试者的扩散特性;以及为神经外科导航和肿瘤切除提供更精确的影像学参考。此外,该数据集也可用于方法学研究,探索新型张量模型在脑部病变表征中的通用性。但具体适用场景需结合源站描述和实际数据内容判断,源站未提供更详细的适用建议。

【使用方法】

使用该数据集时,研究者可基于DTI脑部数据,应用超环面模型计算环面体积(TV)和环面曲率(TC),并分析这些不变量在GBM患者与正常受试者之间的差异。具体处理流程可能包括:数据预处理(如去噪、校正)、张量拟合、超环面模型参数估计、不变量计算以及统计比较。由于源站未提供详细的数据格式、软件工具或代码,使用者需根据自身研究需求选择适当的DTI处理软件,并参考相关文献实现超环面模型。数据集的访问方式、下载链接或使用条款,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于18名GBM患者和18名正常受试者,样本量相对有限,可能影响统计功效和泛化能力。数据采集使用3T扫描仪,但具体扫描参数和质量控制措施未提供。超环面模型作为一种新方法,其有效性和可重复性需进一步验证。此外,数据集未提供关于图像质量、伪影、运动校正、分割精度或临床信息完整性的说明。源站未提供关于数据质量评估、缺失值处理或潜在偏倚的详细信息。因此,使用者在解释结果时应谨慎,并考虑样本量和模型假设的限制。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及相关发表文献信息,源站未提供。使用者应直接访问来源站search.dataone.org获取最新的引用和许可要求。

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源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3Abb1d9b358774fc6bafd1873daaee4b9ff2cbe278434750c37fb1b6dc3444e327

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的:弥散张量成像(DTI)是一种强大的成像技术,它促进了脑部病变诊断与预后的改善以及肿瘤切除术中神经外科导航的进步。然而,传统的张量建模在区分肿瘤浸润区域与瘤周水肿方面存在困难。在此,我们描述超环面模型,该模型结合了表面亏格的增加和环面形状的连续统,以改进对多形性胶质母细胞瘤(GBM)的表征。材料与方法:使用3T扫描仪获取了18名GBM患者和18名正常受试者的DTI脑数据集。应用并评估了弥散张量的超环面模型以及两个新的弥散张量不变量——一个用于评估弥散度,即环面体积(TV),另一个用于评估各向异性,即环面曲率(TC)——在GBM脑肿瘤表征中的作用。将TV和TC与平均弥散度(MD)和分数各向异性……进行了比较。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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