TCGA-PCPG 集合的 DICOM 转换幻灯片显微图像
该数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）[1] 提供的一组图像和/或图像衍生数据。该数据集已转换为 DICOM 表示形式，并由 IDC 团队收录
基本信息
资源简介
TCGA-PCPG 集合的 DICOM 转换幻灯片显微图像
该数据集英文名为 DICOM converted Slide Microscopy images for the TCGA-PCPG collection，对应美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）提供的一组图像和/或图像衍生数据，已转换为 DICOM 表示形式并由 IDC 团队收录。数据集在站内分类中归入肿瘤 / 脑肿瘤方向，来源站为 doi.org，由 Zenodo 机构发布，发布时间为 2024 年，采用 Creative Commons Attribution 3.0 Unported 许可。数据集作者包括 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika 与 Fedorov, Andrey。整体而言，该数据集面向 TCGA-PCPG 集合，提供经 DICOM 转换的幻灯片显微图像，可用于探索和可视化相应图像内容。
【数据集背景】
该数据集对应 TCGA-PCPG 集合，属于美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）所提供图像和/或图像衍生数据的一部分。根据源站描述，该数据集由 IDC 团队转换为 DICOM 表示形式并完成收录。TCGA-PCPG 集合涉及嗜铬细胞瘤与副神经节瘤相关疾病背景。源站描述指出，副神经节瘤是一种罕见癌症，起源于肾上腺的神经细胞，肾上腺是位于两侧肾脏上方、可产生重要激素的器官。发生在肾上腺中央的副神经节瘤被称为嗜铬细胞瘤；形成于肾上腺之外、常沿头颈部血管和神经分布的副神经节瘤，则被称为肾上腺外副神经节瘤。该数据集即围绕这一疾病集合，提供经 DICOM 转换的幻灯片显微图像及相关图像衍生数据。
【数据内容】
该数据集的内容为 DICOM converted Slide Microscopy images，即经 DICOM 转换的幻灯片显微图像，对应 TCGA-PCPG 集合。源站描述说明，该数据集对应于一组图像和/或图像衍生数据，这些数据可从美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）获取，并已转换为 DICOM 表示形式、由 IDC 团队收录。数据集包含可用于探索和可视化相应图像的内容。关于图像的具体数量、分辨率、切片层级、染色方法、文件大小或存储结构等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC），对应 TCGA-PCPG 集合。源站描述指出，该数据集由 IDC 团队转换为 DICOM 表示形式并收录。用户可通过 IDC Portal 探索和可视化相应的 TCGA-PCPG 图像。该数据集在 Zenodo 记录中提供了清单文件（manifests），可用于下载集合内容。数据集发布机构为 Zenodo，发布时间为 2024 年。关于原始图像的采集设备、扫描参数、临床来源、样本处理流程或转换技术细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于对 TCGA-PCPG 集合中经 DICOM 转换的幻灯片显微图像进行探索和可视化。源站描述提到，用户可以使用 IDC Portal 探索和可视化相应的图像。此外，该数据集可用于下载 TCGA-PCPG 集合内容，以便在本地或相关系统中进一步查看和使用这些 DICOM 表示的图像及图像衍生数据。关于具体的科研分析场景、诊断用途、算法训练用途或临床决策支持用途，源站未提供。
【使用方法】
根据源站描述，用户可以通过 IDC Portal 探索和可视化对应的 TCGA-PCPG 图像。该 Zenodo 记录中包含清单文件（manifests），用户可按照下载说明，利用这些清单下载集合内容。关于下载后的具体读取方式、软件要求、DICOM 查看器配置、数据处理步骤或转换后数据的组织方式，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集已转换为 DICOM 表示形式，并由 IDC 团队收录，来源为美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）。源站描述将其定位为图像和/或图像衍生数据的集合，并提供清单文件用于下载。关于数据质量评估、完整性、标注准确性、缺失情况、偏倚、适用范围限制或使用风险，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika 与 Fedorov, Andrey，发布机构为 Zenodo，发布时间为 2024 年。许可方式为 Creative Commons Attribution 3.0 Unported。源站描述中提及美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）[1]，并建议用户通过 IDC Portal 探索和可视化相应的 TCGA-PCPG 图像。关于具体引用格式、DOI 编号、版本信息或附加使用条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.12689964
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 137.9 KB。
数据说明
本数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）[1]中可获取的一组图像和/或图像衍生数据。该数据集已由IDC团队转换为DICOM格式并录入。您可以通过IDC门户网站（此处：TCGA-PCPG）浏览和可视化相应的图像。您可以使用本Zenodo记录中包含的清单文件，按照下方下载说明下载该集合的内容。集合描述：副神经节瘤是一种罕见癌症，起源于肾上腺的神经细胞，肾上腺是位于每个肾脏顶部、产生重要激素的器官。发生在肾上腺中心的副神经节瘤称为嗜铬细胞瘤。发生在肾上腺外的副神经节瘤，通常沿头颈部的血管和神经分布，称为肾上腺外副神经节瘤，或简称为副神经节瘤。全球每年每百万人中有2至8人被诊断为副神经节瘤和嗜铬细胞瘤。所有病例中10%发生在儿童。在成人和儿童中，嗜铬细胞瘤均比副神经节瘤更为常见。
目前尚未发现与这些癌症相关的已知环境、饮食或生活方式风险因素。请参阅 TCGA-PCPG 信息页面，以了解更多关于这些图像的信息，并获取该集合的任何支持性元数据。引用指南可在“在出版物和演示中引用 TCGA”信息页面上找到。包含的文件清单文件的名称指示了该集合数据版本首次引入时的 IDC 数据发布版本。例如，collection_id-idc_v8-aws.s5cmd 对应于 IDC 数据发布 v8 中引入的 collection_id 集合的内容。如果此 Zenodo 页面有后续版本，它将指明相应集合的后续版本是何时引入的。tcga_pcpg-idc_v10-aws.s5cmd：可从公共 IDC Amazon Web Services 存储桶下载的文件的清单 tc
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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