区分胶质瘤与健康个体的18种血清细胞因子特征数据集

该数据集来自一项血清细胞因子特征研究,对26名健康个体和194名不同级别胶质瘤患者的血清样本进行了48种细胞因子检测。研究将正常与IV级胶质瘤/GBM血清样本随机等分为训练集和测试集,在训练集中通过Prediction Analysis for Microarrays(PAM)筛选出18种细胞因子组

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基因组分类cytokinesignatureGliomaserum biomarker
Data from: An eighteen serum cytokine signature for discriminating glioma from normal healthy individuals

基本信息

模态
基因组
大小
0.000084135 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

区分胶质瘤与健康个体的18种血清细胞因子特征数据集

Data from: An eighteen serum cytokine signature for discriminating glioma from normal healthy individuals

该数据集来自一项血清细胞因子特征研究,对26名健康个体和194名不同级别胶质瘤患者的血清样本进行了48种细胞因子检测。研究将正常与IV级胶质瘤/GBM血清样本随机等分为训练集和测试集,在训练集中通过Prediction Analysis for Microarrays(PAM)筛选出18种细胞因子组合,用于区分GBM血清与正常血清。该数据可用于胶质瘤血清生物标志物的分类建模与验证(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2016。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):胶质母细胞瘤(GBM)因弥漫性浸润邻近脑组织且早期难以诊断,在很大程度上无法治愈。源自血清的生物标志物可通过微创手段获取,可能有助于早期诊断、预后判断和治疗监测。为开发血清细胞因子特征,我们对来自正常健康个体(n = 26)和不同级别胶质瘤患者(n = 194)的血清中的48种细胞因子进行了分析。我们将正常和IV级胶质瘤/GBM血清样本随机等分为训练集和测试集。在训练集中,微阵列预测分析(PAM)鉴定出一组18种细胞因子,能够以最高准确率(95.40%)和最小误差(4.60%)区分GBM血清与正常血清。在训练集中获得的18种细胞因子特征在测试集中区分GBM血清与正常血清的效果同样为

【主题与分类】

主题标签:cytokine、signature、Glioma、serum biomarker。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.8jq92

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.8jq92

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 84.1 KB。

数据说明

胶质母细胞瘤(GBM)在很大程度上无法治愈,因为它们会弥漫性浸润邻近的脑组织,且早期难以诊断。源自血清的生物标志物可通过微创手段获取,可能有助于早期诊断、预后判断和治疗监测。为建立血清细胞因子特征谱,我们对来自正常健康个体(n = 26)和不同级别胶质瘤患者(n = 194)的血清中的48种细胞因子进行了分析。我们将正常和IV级胶质瘤/GBM血清样本随机分为等量的训练集和测试集。在训练集中,微阵列预测分析(PAM)识别出一组18种细胞因子,能够以最高准确率(95.40%)和最低误差(4.60%)区分GBM血清与正常血清。在训练集中获得的18种细胞因子特征谱在测试集中同样能够区分GBM血清与正常血清(准确率96.55%;误差3.45%)。有趣的是,该18种细胞因子特征谱还能非常有效地将II级/弥漫性星形细胞瘤(DA)和III级/间变性星形细胞瘤(AA)血清与正常血清区分开来(DA vs. 正常——准确率96.00%,误差4.00%;AA vs.

正常准确率为95.83%,误差为4.17%。利用18种细胞因子进行的京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,显著富集了两条通路:细胞因子-细胞因子受体相互作用和JAK-STAT通路。因此,我们的研究识别出了一种18种细胞因子特征,用于区分胶质瘤血清与正常健康个体血清,并证明了它们在胶质瘤生物学中差异丰度的重要性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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