辐射相关神经肿瘤中NF2突变分析

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT00340496

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：神经肿瘤。儿童期因扁桃体和腺样体肥大等良性疾病接受X射线治疗的成年人，发生神经系统肿瘤的风险增加。风险最高的是神经鞘瘤（RR为33.1，95%CI为9.4-116.5），中等的是脑膜瘤（RR为9.5，95%CI为3.5-25.7），最低的是胶质瘤（RR为2.6，95%CI为0.8-8.6）。对这些类型散发性肿瘤的研究已证实存在NF2基因的体细胞突变。由于这些突变通常不见于其他类型的肿瘤，因此被认为正是导致散发性神经肿瘤发生的原因。同一基因的种系突变可导致一种称为神经纤维瘤病2型（NF2）的常染色体显性遗传病，其特征是发生类似类型的神经肿瘤。拟开展本研究的目的是确定在儿童期接受X射线治疗者中所发生的神经肿瘤是否也具有体细胞NF2突变。为此，将使用约112名因头颈部良性疾病在儿童期接受X射线治疗者中所发生的、经石蜡包埋的神经肿瘤的DNA进行检测。

这些人来自一个由芝加哥Michael Reese医院自1974年以来随访的4000多名受照射者组成的队列。如果我们在与辐射相关的肿瘤中发现NF2突变，我们将通过检测所研究肿瘤患者颊细胞DNA中的NF2突变，来确定这些突变是体细胞突变还是生殖系突变。我们预计大多数患者仅在肿瘤DNA中具有NF2突变。然而，存在一种极小的可能性，即一名或多名患者可能具有生殖系NF2突变，从而即使在未接受X射线治疗的情况下也有发生神经肿瘤的风险增加。然后，我们将把体细胞NF2突变的类型和频率与散发性神经肿瘤中发现的突变进行比较。如果我们在与辐射相关的肿瘤中未发现体细胞NF2突变，我们将得出结论，即X射线通过以下方式导致神经肿瘤发生：

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。