SPP1+巨噬细胞在胶质瘤预后与治疗靶向中作用的补充文件8

该数据集为研究论文的补充文件8,包含8个表格,涉及低级别胶质瘤患者单细胞数据的标记基因、细胞类型注释、跨级别胶质瘤患者TAM与淋巴细胞簇标记基因、TCGA与CGGA队列患者特征、三个TAM亚群的标志性标记以及所用公共单细胞数据集汇总

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2024-09-11 更新
浏览 8
基因组分类GliomaTumor-associated macrophagesTAM-SPP1EGFRImmune suppression
Additional file 8 of Revealing the role of SPP1+ macrophages in glioma prognosis and therapeutic targeting by investigating tumor-associated macrophage landscape in grade 2 and 3 gliomas

基本信息

模态
基因组
大小
0.000317923 GB
任务类型
分类
许可
CC BY + CC0
创建/更新时间
2024-09-11
版本
v1

资源简介

SPP1+巨噬细胞在胶质瘤预后与治疗靶向中作用的补充文件8

Additional file 8 of Revealing the role of SPP1+ macrophages in glioma prognosis and therapeutic targeting by investigating tumor-associated macrophage landscape in grade 2 and 3 gliomas

该数据集为研究论文的补充文件8,包含8个表格,涉及低级别胶质瘤患者单细胞数据的标记基因、细胞类型注释、跨级别胶质瘤患者TAM与淋巴细胞簇标记基因、TCGA与CGGA队列患者特征、三个TAM亚群的标志性标记以及所用公共单细胞数据集汇总。数据覆盖2级和3级胶质瘤的肿瘤相关巨噬细胞景观,可用于胶质瘤免疫微环境分析、SPP1+巨噬细胞相关预后与治疗靶点研究(来源 figshare,CC BY + CC0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Revealing the role of SPP1+ macrophages in glioma prognosis and therapeutic targeting by investigating tumor-associated macrophage landscape in grade 2 and 3 gliomas》发表于 Cell & Bioscience(2024),DOI:10.1186/s13578-024-01218-4。源站首次发布:2024-09-11。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):补充文件8:表S1. 来自两名低级别患者的七个主要簇的标记基因。表S2. 通过ScType进行细胞类型注释的详细信息。表S3. 来自低级别患者的13个簇的标记基因。表S4. 来自17名跨级别胶质瘤患者的每个TAM簇和淋巴细胞簇的标记基因。表S5. TCGA队列的患者特征。表S6. CGGA队列的患者特征。表S7. 三个TAM亚群的标志性标记。表S8. 本研究中使用的公共单细胞数据集汇总。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 317.92 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.26993650.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Immunology。主题标签:Glioma、Tumor-associated macrophages、TAM-SPP1、EGFR、Immune suppression。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Immunology。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_8_of_Revealing_the_role_of_SPP1_macrophages_in_glioma_prognosis_and_therapeutic_targeting_by_investigating_tumor-associated_macrophage_landscape_in_grade_2_and_3_gliomas/26993650

使用许可:CC BY + CC0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Tang, Wenshu; Lo, Cario W. S.; Ma, Wei; Chu, Annie T. W.; Tong, Amy H. Y.; Chung, Brian H. Y. (2024). Additional file 8 of Revealing the role of SPP1+ macrophages in glioma prognosis and therapeutic targeting by investigating tumor-associated macrophage landscape in grade 2 and 3 gliomas. figshare.…

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.26993650

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 317.9 KB。

数据说明

补充文件8:表S1。两名低级别患者的七个主要集群的标志基因。表S2。ScType细胞类型注释详情。表S3。低级别患者13个集群的标志基因。表S4。17名跨级别胶质瘤患者中每个TAM集群和淋巴细胞集群的标志基因。表S5。TCGA队列的患者特征。表S6。CGGA队列的患者特征。表S7。三个TAM亚群的标志性标记。表S8。本研究中使用的公共单细胞数据集汇总。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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