膀胱癌Notch信号通路基因突变作为预后生物标志物的识别
该数据集包含膀胱癌患者的基因突变数据，主要聚焦于Notch信号通路相关基因（如NOTCH7、CNTN6、CREBBP等），通过分析癌症基因组图谱和验证集，结合免疫浸润、蛋白质相互作用网络和富集分析，旨在识别可作为免疫治疗预后生物标志物的基因突变，并探索潜在的药物靶点（如IRF1和B2M），用于预测膀胱癌患者对免疫治疗的反应和预后评估。
基本信息
资源简介
膀胱癌Notch信号通路基因突变作为预后生物标志物的识别
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Identification of Notch Signaling Pathway Gene Mutations as a Prognostic Biomarker for Bladder Cancer》。配套论文《Identification of Notch Signaling Pathway Gene Mutations as a Prognostic Biomarker for Bladder Cancer》发表于 Future Oncology（2021），DOI：10.2217/fon-2021-0110。源站首次发布：2025-01-16。
【数据内容】
源站原始描述：Purpose: The authors aimed to identify Notch signaling pathway gene mutations as a prognostic biomarker for bladder cancer. Methods: First, critical Notch signaling pathway genes were screened using The Cancer Genome Atlas and validation sets. Second, immune infiltration, protein–protein interaction network, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes and Gene Set Enrichment Analysis analyses were performed. Finally, potential immunotherapy drug targets were screened using T-cell receptors, B-cell r…
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个，合计 41.47 KB。ifon_a_12333177_sm0001.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，12.68 KB。ifon_a_12333177_sm0002.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，14.01 KB。ifon_a_12333177_sm0003.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，14.78 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.28219645.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Pharmacology。主题标签：bladder cancer、gene mutation、immunotherapy、Notch signaling pathway、prognostic biomarker。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Pharmacology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Identification_of_Notch_Signaling_Pathway_Gene_Mutations_as_a_Prognostic_Biomarker_for_Bladder_Cancer/28219645
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Identification of Notch Signaling Pathway Gene Mutations as a Prognostic Biomarker for Bladder Cancer. Taylor & Francis. Xue, Chong; Chen, Xin; Lin, KaoXing; Tong, YunGuang; Wang, XinHong
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数据说明
该数据集旨在识别Notch信号通路基因突变作为膀胱癌的预后生物标志物。数据集基于癌症基因组图谱（TCGA）和验证集筛选关键Notch信号通路基因，并进行了免疫浸润、蛋白质-蛋白质相互作用网络、京都基因与基因组百科全书以及基因集富集分析。此外，还利用T细胞受体、B细胞受体和CERES评分筛选了潜在的免疫治疗药物靶点。研究发现NOTCH7基因突变在膀胱癌中与免疫浸润水平（主要与T细胞相关）存在显著差异，可作为免疫治疗的预后因子，而IRF1和B2M是NOTCH7突变的潜在药物靶点。结论表明，NOTCH7基因突变可作为膀胱癌免疫治疗的生物标志物，且研究识别出CNTN6、CREBBP、EP300、NCOR1、NCOR2、NOTCH2和SPEN等七个Notch信号通路相关基因可用于预测患者对免疫治疗的反应。
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