原发性纵隔B细胞淋巴瘤细胞系基因组景观
该数据集包含原发性纵隔B细胞淋巴瘤(PMBL)四个细胞系(FARAGE、KARPAS-1106P、MEDB-1、U-2940)的基因组学数据,通过微阵列技术获取染色体变异、缺失、扩增及纯合区域等基因模态信息,结合表达谱分析揭示PMBL的基因组特征与关键基因位点,主要用于癌症基因组学研究和淋巴瘤靶点发现,为生物标志物鉴定与临床前模型开发提供支持。

基本信息
资源简介
原发性纵隔B细胞淋巴瘤细胞系基因组景观
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genomic Landscape of Primary Mediastinal B-Cell Lymphoma Cell Lines》。配套论文《Genomic Landscape of Primary Mediastinal B-Cell Lymphoma Cell Lines》发表于 PLOS ONE(2015),DOI:10.1371/journal.pone.0139663。源站首次发布:2015-11-23。
【数据内容】
源站原始描述:Primary mediastinal B-Cell lymphoma (PMBL) is a recently defined entity comprising ~2–10% non-Hodgkin lymphomas (NHL). Unlike most NHL subtypes, PMBL lacks recurrent gene rearrangements to serve as biomarkers or betray target genes. While druggable, late chemotherapeutic complications warrant the search for new targets and models. Well characterized tumor cell lines provide unlimited material to serve as preclinical resources for verifiable analyses directed at the discovery of new biomarkers an…
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个,合计 3.81 MB。S1_Fig.tif:image/tiff,1.26 MB。S2_Fig.tif:image/tiff,1.13 MB。S3_Fig.pdf:application/pdf,880.86 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0139663。
【主题与分类】
源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:PMBL cell lines cluster、jak、FARAGE、litaf、Cell lines、CDKN 2A 20 p 12、tumor cell lines、PMBL cell lines、MEDB、document genomic alterations。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Genomic_Landscape_of_Primary_Mediastinal_B_Cell_Lymphoma_Cell_Lines_/1609880
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Dai, Haiping; Ehrentraut, Stefan; Nagel, Stefan; Eberth, Sonja; Pommerenke, Claudia; G. Dirks, Wilhelm; et al. (2016). Genomic Landscape of Primary Mediastinal B-Cell Lymphoma Cell Lines. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于原发性纵隔B细胞淋巴瘤(PMBL)的基因组学研究,PMBL是一种约占非霍奇金淋巴瘤2-10%的亚型,缺乏常见的基因重排作为生物标志物。数据集通过细胞遗传学和高密度寡核苷酸/SNP微阵列技术,对四个PMBL细胞系(FARAGE、KARPAS-1106P、MEDB-1和U-2940)的基因组改变进行了系统性分析,包括染色体重排、缺失、扩增和纯合区域。研究结合全局表达谱数据,解析了这些基因组变异对基因表达的影响,识别了与PMBL相关的关键基因位点(如2p15、9p24、16p13)以及新的潜在位点(如2p16、6q23)。该数据集为PMBL的病理机制研究、新生物标志物的发现以及临床前药物靶点验证提供了重要的基因组学资源。
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