内皮细胞中敲除Arid1a后,扰乱了血管发生、神经发生和星形胶质细胞发生
该数据集包含来自Arid1a内皮条件敲除小鼠和野生型小鼠内皮细胞的RNA测序数据,属于基因表达模态,通过全基因组分析揭示了Arid1a缺失对血管发生、神经发生和星形胶质细胞发生的调控作用,主要用于研究内皮细胞在发育过程中的分子机制及其在血管生成和神经发育相关疾病中的潜在应用。
基本信息
资源简介
该数据集是一个基于RNA测序的分子生物学数据集,旨在研究内皮细胞中转录因子Arid1a在发育过程中的功能作用。数据来源于对胚胎第15天Arid1a内皮条件敲除小鼠和野生型小鼠分离的内皮细胞进行全基因组RNA测序分析,包含基因表达谱变化信息。通过比较敲除与野生型样本,数据集揭示了Arid1a缺失如何影响血管生成、神经发生和星形胶质细胞发生相关的分子机制,主要应用于发育生物学、血管生物学和神经科学领域的功能基因组学研究。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=644b7fe2f45ac97dd8ad08d9
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个基于RNA测序的分子生物学数据集,旨在研究内皮细胞中转录因子Arid1a在发育过程中的功能作用。数据来源于对胚胎第15天Arid1a内皮条件敲除小鼠和野生型小鼠分离的内皮细胞进行全基因组RNA测序分析,包含基因表达谱变化信息。通过比较敲除与野生型样本,数据集揭示了Arid1a缺失如何影响血管生成、神经发生和星形胶质细胞发生相关的分子机制,主要应用于发育生物学、血管生物学和神经科学领域的功能基因组学研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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