内皮细胞中敲除Arid1a后,扰乱了血管发生、神经发生和星形胶质细胞发生
该数据集包含来自Arid1a内皮条件敲除小鼠和野生型小鼠内皮细胞的RNA测序数据,属于基因表达模态,通过全基因组分析揭示了Arid1a缺失对血管发生、神经发生和星形胶质细胞发生的调控作用,主要用于研究内皮细胞在发育过程中的分子机制及其在血管生成和神经发育相关疾病中的潜在应用。

基本信息
资源简介
内皮细胞中敲除Arid1a后,扰乱了血管发生、神经发生和星形胶质细胞发生
【数据集背景】
本数据集源站标题为《内皮细胞中敲除Arid1a后,扰乱了血管发生,神经发生和星形胶质细胞发生》。源站首次发布:2023-04-28。
【数据内容】
源站原始描述:为了进一步了解内皮细胞Arid1a如何调节血管生成、神经发生和星形发生,我们使用RNA-seq分析了E15 Arid1a内皮条件敲除小鼠和野生型小鼠分离的内皮细胞的全基因组变化。
【主题与分类】
主题标签:血管发生、神经发生、星形胶质细胞发生、命运决定、angiogenesis、neurogenesis、astrogenesis、fate determination、小鼠、血管。
【获取与许可】
源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=644b7fe2f45ac97dd8ad08d9
使用许可:CC0。
规范引用:35786.11.de5d2746b979448a8c091fa01c83a679
下载信息
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数据集获取
源站:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=644b7fe2f45ac97dd8ad08d9
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个基于RNA测序的分子生物学数据集,旨在研究内皮细胞中转录因子Arid1a在发育过程中的功能作用。数据来源于对胚胎第15天Arid1a内皮条件敲除小鼠和野生型小鼠分离的内皮细胞进行全基因组RNA测序分析,包含基因表达谱变化信息。通过比较敲除与野生型样本,数据集揭示了Arid1a缺失如何影响血管生成、神经发生和星形胶质细胞发生相关的分子机制,主要应用于发育生物学、血管生物学和神经科学领域的功能基因组学研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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