内皮细胞中敲除Arid1a后,扰乱了血管发生、神经发生和星形胶质细胞发生

该数据集包含来自Arid1a内皮条件敲除小鼠和野生型小鼠内皮细胞的RNA测序数据,属于基因表达模态,通过全基因组分析揭示了Arid1a缺失对血管发生、神经发生和星形胶质细胞发生的调控作用,主要用于研究内皮细胞在发育过程中的分子机制及其在血管生成和神经发育相关疾病中的潜在应用。

干细胞与再生医学数据中心
2023-04-28 更新
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基因功能研究细胞生物学

基本信息

创建/更新时间
2023-04-28

资源简介

该数据集是一个基于RNA测序的分子生物学数据集,旨在研究内皮细胞中转录因子Arid1a在发育过程中的功能作用。数据来源于对胚胎第15天Arid1a内皮条件敲除小鼠和野生型小鼠分离的内皮细胞进行全基因组RNA测序分析,包含基因表达谱变化信息。通过比较敲除与野生型样本,数据集揭示了Arid1a缺失如何影响血管生成、神经发生和星形胶质细胞发生相关的分子机制,主要应用于发育生物学、血管生物学和神经科学领域的功能基因组学研究。

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http://data.iscr.ac.cn/Article?id=644b7fe2f45ac97dd8ad08d9

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数据说明

该数据集是一个基于RNA测序的分子生物学数据集,旨在研究内皮细胞中转录因子Arid1a在发育过程中的功能作用。数据来源于对胚胎第15天Arid1a内皮条件敲除小鼠和野生型小鼠分离的内皮细胞进行全基因组RNA测序分析,包含基因表达谱变化信息。通过比较敲除与野生型样本,数据集揭示了Arid1a缺失如何影响血管生成、神经发生和星形胶质细胞发生相关的分子机制,主要应用于发育生物学、血管生物学和神经科学领域的功能基因组学研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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