壶腹癌基因表达谱分析：将壶腹癌分为胆管样亚型和肠样亚型及其预后意义
该数据集是一个基于基因表达谱的壶腹癌分子分型数据集，包含32例壶腹周围腺癌样本的基因芯片数据，通过无监督聚类将壶腹癌分为预后不同的肠样亚型和胆管样亚型，并揭示了亚型间在分子标志物和信号通路上的差异，主要用于壶腹癌的预后评估、分子机制研究和临床治疗策略开发。
基本信息
资源简介
壶腹癌基因表达谱分析：将壶腹癌分为胆管样亚型和肠样亚型及其预后意义
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Gene Expression Profiling of Ampullary Carcinomas Classifies Ampullary Carcinomas into Biliary-Like and Intestinal-Like Subtypes That Are Prognostic of Outcome》。配套论文《Gene Expression Profiling of Ampullary Carcinomas Classifies Ampullary Carcinomas into Biliary-Like and Intestinal-Like Subtypes That Are Prognostic of Outcome》发表于 PLoS ONE（2013），DOI：10.1371/journal.pone.0065144。源站首次发布：2013-06-11。
【数据内容】
源站原始描述：Background Adenocarcinomas of the ampulla of Vater are classified as biliary cancers, though the exact epithelium of origin for these cancers is not known. We sought to molecularly classify ampullary adenocarcinomas in comparison to known adenocarcinomas of the pancreas, bile duct, and duodenum by gene expression analysis. Methods We analyzed 32 fresh-frozen resected, untreated periampullary adenocarcinomas (8 pancreatic, 2 extrahepatic biliary, 8 duodenal, and 14 ampullary) using the Affymetrix…
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个，合计 2.35 MB。Figure_S1.tif：image/tiff，1.33 MB。Figure_S2.tif：image/tiff，938.98 KB。Table_S1.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，39.79 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0065144。
【主题与分类】
源站学科分类：Mathematics、Medicine、Biological Sciences。主题标签：Computational biology、genomics、Genome expression analysis、Molecular genetics、gene expression、microarrays、histology、statistics、Biostatistics、Diagnostic medicine。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Mathematics、Medicine、Biological Sciences。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Gene_Expression_Profiling_of_Ampullary_Carcinomas_Classifies_Ampullary_Carcinomas_into_Biliary_Like_and_Intestinal_Like_Subtypes_That_Are_Prognostic_of_Outcome_/716746
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：J. Overman, Michael; Zhang, Jiexin; Kopetz, Scott; Davies, Michael; Zhi-Qin, Jiang; Stemke-Hale, Katherine; et al. (2016). Gene Expression Profiling of Ampullary Carcinomas Classifies Ampullary Carcinomas into Biliary-Like and Intestinal-Like Subtypes That Are Prognostic of Outcome. PLOS ONE. Datase…
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-02，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集是一个针对壶腹癌（Vater壶腹腺癌）的基因表达谱数据集，旨在通过分子特征对壶腹癌进行亚型分类并评估其预后价值。数据集包含32例未经治疗的新鲜冷冻切除的壶腹周围腺癌样本（包括14例壶腹癌、8例胰腺癌、2例肝外胆管癌和8例十二指肠癌），使用Affymetrix U133 Plus 2.0全基因组芯片进行基因表达分析。通过无监督和有监督的层次聚类分析，将壶腹癌区分为两种分子亚型：预后较好的肠样亚型和预后较差的胆管样亚型，并发现这两种亚型在CK7+/CK20-表达、AKT和MAPK通路激活以及患者总生存期（OS）和无复发生存期（RFS）方面存在显著差异。该数据集主要用于壶腹癌的分子分型、预后标志物发现、肿瘤生物学机制研究以及个体化治疗策略的探索。
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