RNA结合蛋白GAPDH在急性髓系白血病中调控转录稳定性和蛋白质翻译
该数据集是一个基于急性髓系白血病(AML)研究的生物医学数据集,包含基因表达、RNA结合靶点(通过CLIP技术鉴定)以及功能通路分析等多模态数据,主要应用于探索GAPDH作为非经典RNA结合蛋白在AML中的分子机制、其对转录稳定性和蛋白质翻译的调控作用,以及相关白血病治疗靶点的发现。
https://tandf.figshare.com/articles/dataset/RNA_binding_of_GAPDH_controls_transcript_stability_and_protein_translation_in_acute_myeloid_leukemia/30508558/1
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资源简介
该数据集聚焦于急性髓系白血病(AML)中非经典RNA结合蛋白(ncRBPs)的功能研究。通过CRISPR/Cas筛选,研究人员发现糖酵解酶GAPDH在AML细胞中具有促进增殖的作用。基于交联免疫沉淀(CLIP)技术,数据集定义了GAPDH的全局RNA靶点组,检测到主要位于5‘UTR区域的新RNA靶点,包括GAPDH、RPL13a和PKM等基因。GAPDH敲低实验揭示了与核糖体生物合成、翻译起始和调控相关的遗传通路。此外,研究证实GAPDH通过结合靶转录本(包括其自身mRNA)发挥稳定作用。这些发现为GAPDH在AML中的RNA功能与特性提供了新见解。数据集包含基因表达、RNA结合靶点、功能通路分析等数据,适用于白血病机制、RNA结合蛋白功能、转录后调控及肿瘤治疗靶点等研究方向。
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