Leucegene 急性髓系白血病转录组数据集
Leucegene 项目是由加拿大魁北克白血病细胞库等机构共同发起的大型AML组学队列研究。该数据集以RNA-Seq转录组测序为主，包含了近700例急性髓系白血病初发及复发样本的高质量表达谱数据。研究人员可通过挖掘该队列识别不同预后亚群的特异性基因表达模式、寻找潜在表面抗原靶点，是研究AML分子分型的重要补充。
基本信息
模态
表格
数据量
691
任务类型
聚类
许可
GEO Data Usage Policy
创建/更新时间
2023-01-01
资源简介
旨在通过高通量转录组测序解析AML亚型及预后特征，包含数百例原发性AML样本的深度测序表达谱数据。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后，才能进行数据下载，注册有对应要求，或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载，应该可以免费公开下载。
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.leucegene.iric.ca/
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
旨在通过高通量转录组测序解析AML亚型及预后特征，包含数百例原发性AML样本的深度测序表达谱数据。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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