Leucegene 急性髓系白血病转录组数据集
Leucegene 项目是由加拿大魁北克白血病细胞库等机构共同发起的大型AML组学队列研究。该数据集以RNA-Seq转录组测序为主,包含了近700例急性髓系白血病初发及复发样本的高质量表达谱数据。研究人员可通过挖掘该队列识别不同预后亚群的特异性基因表达模式、寻找潜在表面抗原靶点,是研究AML分子分型的重要补充。

基本信息
资源简介
Leucegene 急性髓系白血病转录组数据集
【一句话概览】
Leucegene 项目旨在为急性髓系白血病(AML)患者的个性化医疗开辟新路径。当前样本队列由 BCLQ 获取和管理,共包含 529 份原发样本,其中 452 份为 AML 样本,373 份被归类为诊断性 AML 样本(不包括急性早幼粒细胞白血病 APL)。该项目涉及转录组学、测序、突变、生存及基因表达等方向(来源 data.leucegene.iric.ca)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Leucegene》。
【数据内容】
源站原始描述:The Leucegene project aims at paving the way for a new era in personalized medicine for patients suffering from acute myeloid leukemia (AML). The current sample cohort consists of 529 primary samples acquired and managed by the BCLQ among which 452 are AML samples with 373 samples classified as diagnostic AML samples (excluding acute promyelocytic leukemia (APL))
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):Leucegene项目旨在为急性髓系白血病(AML)患者的个性化医疗开辟新纪元。当前样本队列包含由BCLQ获取和管理的529份原发性样本,其中452份为AML样本,373份被归类为诊断性AML样本(不包括急性早幼粒细胞白血病(APL))。
【主题与分类】
主题标签:acute myeloid leukemia、AML、transcriptomic、sequencing、mutations、survival、gene expression。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://data.leucegene.iric.ca/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://data.leucegene.iric.ca/
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
旨在通过高通量转录组测序解析AML亚型及预后特征,包含数百例原发性AML样本的深度测序表达谱数据。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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