基本信息

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创建/更新时间

2026-10-18

资源简介

AML患者HSCT后诊断与复发样本转录组分析

E-MTAB-7456 是一项收录于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集，物种为 Homo sapiens，主题标签为 Differential。该数据集聚焦急性髓系白血病（AML）患者在接受造血干细胞移植（HSCT）后，于诊断期与复发期采集样本所开展的转录组分析，旨在从转录组层面呈现这两个疾病阶段之间的表达差异。数据集英文全称为 Transcriptome analysis of AML samples at diagnosis and relapse after Hematopoietic Stem Cell Transplantation (HSCT)，本站将其归入肿瘤 / 急性髓系白血病分类，来源站为 ebi.ac.uk。整体而言，该数据集属于肿瘤转录组学范畴，围绕造血干细胞移植前后 AML 样本的基因表达差异展开，可为关注白血病复发机制与移植后疾病演变的研究者提供一份以差异表达为核心的实验数据资源。

【数据集背景】

急性髓系白血病是一种起源于髓系造血干/祖细胞的恶性血液肿瘤，造血干细胞移植是治疗该类疾病的重要手段之一，但移植后复发仍是临床面临的突出问题。理解诊断期与复发期肿瘤细胞在转录组层面的差异，有助于刻画疾病在治疗压力下的表达变化特征。E-MTAB-7456 正是围绕这一临床情境设计的转录组分析实验，其研究对象为 AML 患者，比较的时间点为诊断期与造血干细胞移植后复发期。该数据集以差异表达为实验类型，属于 EBI Expression Atlas 收录的实验之一，主题标签为 Differential，体现了其以组间表达差异为主要分析目标的数据属性。

【数据内容】

该数据集的内容为 AML 样本在诊断期与复发期的转录组分析结果，实验类型为差异表达实验，物种为 Homo sapiens。数据集名称明确指向“诊断期”与“HSCT 后复发期”两个样本分组，因此其数据内容围绕这两个阶段样本之间的基因表达比较展开。本站分类将其归入肿瘤 / 急性髓系白血病，主题标签为 Differential，说明该数据集的核心产出是差异表达层面的信息，而非单纯的表达谱罗列。关于样本数量、测序平台、基因数量、差异基因数目等具体指标，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk，是 EBI Expression Atlas 中的一项实验记录，源站对其的描述为 Expression Atlas experiment (Differential)，物种为 Homo sapiens，内容为 AML 样本在诊断期与 HSCT 后复发期的转录组分析。数据集的英文名称中已标明其研究对象与比较设计，即造血干细胞移植后诊断期与复发期 AML 样本的转录组分析。关于样本采集地点、采集时间跨度、伦理审批信息、具体测序平台与建库方法等细节，源站未提供。

【适用场景】

基于其差异表达实验的属性与 AML / HSCT 的研究背景，该数据集适用于关注急性髓系白血病移植后复发相关转录组变化的研究场景，例如比较诊断期与复发期样本表达差异、筛选与复发相关的候选基因或表达特征、以及作为白血病转录组差异表达分析的参考数据。同时，由于其收录于 EBI Expression Atlas 并带有 Differential 主题标签，也可用于差异表达分析方法的示例与验证性研究。关于该数据集在具体疾病机制研究或临床转化中的明确用途，源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 EBI Expression Atlas 中的实验记录，可通过来源站 ebi.ac.uk 访问。关于数据下载格式、文件组织方式、差异表达分析流程、标准化方法以及配套分析工具等具体使用说明，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 EBI Expression Atlas 收录的差异表达实验，物种明确为 Homo sapiens，研究主题明确为 AML 诊断期与 HSCT 后复发期的转录组比较。关于样本量大小、数据完整性、批次效应、质量控制指标及潜在偏倚等质量相关信息，源站未提供。使用时应结合源站记录自行核实数据范围与适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议与使用条款，源站未提供。

原始链接

https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-7456

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-7456

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Transcriptome analysis of AML samples at diagnosis and relapse after Hematopoietic Stem Cell Transplantation (HSCT)

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别