急性髓系白血病原癌基因与抑癌基因启动子序列中胞嘧啶与CpG岛密度检测
该数据集包含急性髓系白血病的原癌基因、抑癌基因及对照基因的启动子序列数据，通过分析这些序列中胞嘧啶重复序列和CpG岛的密度分布，揭示了甲基化潜在位点与转录起始位点的关联，主要用于癌症表观遗传学和白血病分子机制的研究。
基本信息
资源简介
急性髓系白血病原癌基因与抑癌基因启动子序列中胞嘧啶与CpG岛密度检测
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Detection of cytosine and CpG density in proto-oncogenes and tumor suppressor genes in promoter sequences of acute myeloid leukemia》。配套论文《Detection of cytosine and CpG density in proto-oncogenes and tumor suppressor genes in promoter sequences of acute myeloid leukemia》发表于 Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids（2017），DOI：10.1080/15257770.2017.1279738。源站首次发布：2017-03-21。
【数据内容】
源站原始描述：Aberrant methylation is one of the driving forces of cancer genome development. Although the rate of methylation appears massively variable across the genome, it is mainly observed in histone modification, chromatin organization, DNA accessibility, or promoter sequence. Methylation of promoter sequence occurs mostly to cytosine nucleotides, which can affect transcription factors'' binding affinities. In this study, we demonstrated that cytosine repeats (C types density), consisting of CC, CCC, CC…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 89.17 KB。lncn_a_1279738_sm9328.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，56.48 KB。lncn_a_1279738_sm6653.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，32.69 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.4772305.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biophysics、Genetics、Molecular Biology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Science Policy、Marine Biology。主题标签：Cytosine density、CpG island、nucleic acid structures of promoter sequences、methylation of cytosine locations。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Genetics、Molecular Biology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Science Policy、Marine Biology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Detection_of_cytosine_and_CpG_density_in_proto-oncogenes_and_tumor_suppressor_genes_in_promoter_sequences_of_acute_myeloid_leukemia/4772305
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Detection of cytosine and CpG density in proto-oncogenes and tumor suppressor genes in promoter sequences of acute myeloid leukemia. Taylor & Francis. Dogan, Senol; Cilic, Anis; Marjanovic, Damir; Kurtovic-Kozaric, Amina
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集聚焦于急性髓系白血病（AML）中启动子序列的甲基化研究。数据包含25个原癌基因、抑癌基因及对照基因的启动子序列，通过分析这些序列在特定核苷酸窗口（如-500至+100的100个核苷酸窗口和-100至+100的20个核苷酸窗口）中的胞嘧啶重复序列密度（包括CC、CCC等重复模式）和CpG岛密度，以探究其与AML发病机制的关系。数据来源于对启动子序列的生物信息学分析，旨在揭示甲基化潜在位点的分布规律，特别是靠近转录起始位点（TSS）区域的密度变化。该数据集主要用于癌症基因组学、表观遗传学及白血病分子机制的研究，为理解启动子甲基化在肿瘤发生中的作用提供数据支持。
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