MED1野生型与敲除人pre-B ALL细胞系697转录组分析(RNA-seq)
该数据集来自EBI Expression Atlas的差异表达实验,针对人pre-B急性淋巴细胞白血病细胞系697,比较MED1野生型与敲除后的转录组(RNA-seq)表达谱

基本信息
资源简介
MED1野生型与敲除人pre-B ALL细胞系697转录组分析(RNA-seq)
E-MTAB-8178 是一项来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,全称为“Transcriptome profiling of MED1 wild-type and knockout human pre-B ALL cell line 697 (RNA-seq)”。该数据集以人 pre-B 急性淋巴细胞白血病细胞系 697 为研究对象,通过 RNA-seq 技术对 MED1 野生型与 MED1 敲除后的转录组表达谱进行比较分析,属于肿瘤领域中急性淋巴细胞白血病方向的基础研究数据。数据集的主题标签为“Differential”,表明其核心价值在于呈现两组样本之间的差异表达信息,可供研究者了解 MED1 基因状态改变对 697 细胞系转录组的影响。
【数据集背景】
该数据集聚焦于急性淋巴细胞白血病(ALL)这一肿瘤类型,具体针对的是人 pre-B 急性淋巴细胞白血病细胞系 697。研究围绕 MED1 基因展开,通过对比 MED1 野生型与敲除型细胞的转录组,考察该基因在白血病细胞表达调控中的作用。数据集归属于 EBI Expression Atlas 中的差异表达实验类别,物种为 Homo sapiens,整体设计属于典型的体外细胞系转录组比较研究。
【数据内容】
数据集的内容为 MED1 野生型与 MED1 敲除的人 pre-B ALL 细胞系 697 的转录组表达谱,采用 RNA-seq 技术获得。数据以差异表达实验的形式组织,主题标签为“Differential”,即重点呈现两组条件之间的表达差异。关于具体的样本数量、测序深度、差异基因数目等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,是 EBI Expression Atlas 中的一个实验记录,编号为 E-MTAB-8178。源站将其描述为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens。关于样本采集、文库构建、测序平台与具体实验流程等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于急性淋巴细胞白血病相关的转录组研究,尤其是关注 MED1 基因功能的研究场景。研究者可将其用于比较 MED1 野生型与敲除状态下 697 细胞系的基因表达差异,辅助探索 MED1 在 pre-B ALL 细胞中的调控作用;也可作为差异表达分析、候选基因筛选或方法学比较的参考数据。关于更具体的应用案例,源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 EBI Expression Atlas 平台访问,实验编号为 E-MTAB-8178。使用者可依据 Expression Atlas 的差异表达实验浏览方式查看比较结果。关于数据下载格式、分析流程与参数设置等具体操作说明,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于人细胞系 697 的体外实验,结果反映的是特定细胞系在 MED1 野生型与敲除条件下的转录组差异,外推到临床样本或其他细胞背景时需谨慎。关于数据质量评估指标、重复数、批次效应等信息,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 EBI Expression Atlas,实验编号为 E-MTAB-8178。关于具体的引用文献、作者信息与许可条款,源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-8178
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Transcriptome profiling of MED1 wild-type and knockout human pre-B ALL cell line 697 (RNA-seq)
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