USP18依赖性肌肉蛋白质组
主题标签:肌肉骨骼疾病、肌肉蛋白质组、USP18、蛋白质组学。本站分类:肌肉骨骼疾病/其他。本数据集为肌肉骨骼疾病领域公开数据集,主题涵盖肌肉骨骼疾病。

基本信息
资源简介
USP18依赖性肌肉蛋白质组
USP18-dependent muscle proteome 是一个公开的肌肉蛋白质组学数据集,主题标签涵盖肌肉骨骼疾病、肌肉蛋白质组、USP18 与蛋白质组学,在分类上归属于肌肉骨骼疾病领域的“其他”类别。该数据集由 Cyriel Olie 提交,可通过欧洲生物信息学研究所(ebi.ac.uk)的 PRIDE 存档平台获取,项目编号为 PXD032406。从主题构成看,该数据集围绕 USP18 依赖的肌肉蛋白质组展开,将 USP18 这一因子与肌肉组织的蛋白质组学分析联系起来,为肌肉骨骼疾病相关研究提供了可公开访问的数据资源。整体而言,该数据集属于肌肉骨骼疾病领域的公开数据集,其主题涵盖肌肉骨骼疾病,并以蛋白质组学作为主要数据形态。
【数据集背景】
该数据集的主题标签明确指向肌肉骨骼疾病、肌肉蛋白质组、USP18 与蛋白质组学,说明其研究语境位于肌肉骨骼疾病领域,并以肌肉组织的蛋白质组为观察对象。数据集中“USP18-dependent”的表述表明,其关注点与 USP18 这一因子对肌肉蛋白质组的影响相关。数据集在分类体系中归入肌肉骨骼疾病下的“其他”类别,表明其具体疾病指向未进一步细分。关于该数据集产生的具体研究背景、所针对的疾病模型或生物学问题,源站未提供。
【数据内容】
从名称与主题标签可知,该数据集的内容为肌肉蛋白质组数据,且与 USP18 依赖性的条件相关。其数据形态属于蛋白质组学数据,主题涵盖肌肉骨骼疾病。关于样本数量、蛋白质鉴定数量、定量指标、实验分组、仪器参数等具体内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体为 PRIDE 存档平台的项目 PXD032406,提交者为 Cyriel Olie。数据集的正式引用描述为“Cyriel Olie, USP18-dependent muscle proteome [Dataset]”,并附有 PRIDE 项目链接。关于样本采集的具体组织来源、物种、处理流程与实验设计,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签与分类,该数据集适用于肌肉骨骼疾病领域的蛋白质组学研究场景,尤其是涉及肌肉蛋白质组与 USP18 依赖性分析的方向。它可作为公开数据资源,用于相关主题的数据查阅与再利用。关于具体的适用分析类型或验证用途,源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE 存档平台,以项目编号 PXD032406 进行访问与获取。关于数据文件格式、下载方式、分析流程与使用条件,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 PRIDE 存档平台上的公开数据集,其来源站与项目编号明确。关于数据质量评估指标、技术验证情况、覆盖度与潜在偏差,源站未提供。其分类归入“其他”类别,具体疾病指向未进一步细化。
【引用与许可】
引用该数据集时,可参照源站描述中的形式:Cyriel Olie, USP18-dependent muscle proteome [Dataset], https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD032406。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD032406
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Cyriel Olie, USP18-dependent muscle proteome [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD032406
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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