Scilifelab亲和蛋白质组学BIONMD 384plex抗体磁珠阵列BurcuAyoglu数据集

该数据集来自omicsdi.org,属于肌肉骨骼疾病/其他分类,主题标签为Proteomics。数据基于抗体悬浮磁珠阵列,对来自4个不同临床站点的Duchenne和Becker肌营养不良患者、非患病对照及携带者的血浆样本进行蛋白质组学分析

omicsdi
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蛋白质分类Proteomics
Scilifelab-AffinityProteomics-BIONMD-384plex.Antibody.Bead.Array_BurcuAyoglu

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

Scilifelab亲和蛋白质组学BIONMD 384plex抗体磁珠阵列BurcuAyoglu数据集

Scilifelab-AffinityProteomics-BIONMD-384plex.Antibody.Bead.Array_BurcuAyoglu 是一个收录于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集,归类于肌肉骨骼疾病 / 其他方向。该数据集围绕抗体悬浮磁珠阵列技术展开,对血浆样本进行蛋白质组学层面的分析。其样本来源具有明确的多中心特征,覆盖 4 个不同临床站点,纳入对象包括 Duchenne 肌营养不良患者、Becker 肌营养不良患者、非患病对照以及携带者。整体来看,该数据集以抗体悬浮磁珠阵列为核心技术手段,面向肌营养不良相关人群的血浆样本开展蛋白质组学检测,主题标签为 Proteomics,可为肌肉骨骼疾病特别是肌营养不良方向的蛋白质组学研究提供数据资源。

【数据集背景】

该数据集所属分类为肌肉骨骼疾病 / 其他,主题标签为 Proteomics。其英文名称中包含 Scilifelab、AffinityProteomics、BIONMD、384plex、Antibody、Bead、Array 以及 BurcuAyoglu 等标识信息。从来源站 omicsdi.org 的描述可知,该数据集针对的是 Duchenne 和 Becker 肌营养不良患者、非患病对照及携带者,采集其血浆样本进行抗体悬浮磁珠阵列分析。Duchenne 和 Becker 肌营养不良属于肌肉骨骼疾病范畴,该数据集正是在这一疾病背景下,借助蛋白质组学手段对相关人群的血浆样本进行检测与分析。

【数据内容】

该数据集的核心内容是基于抗体悬浮磁珠阵列对血浆样本进行蛋白质组学分析。源站描述明确指出,其分析对象为采集自 Duchenne 和 Becker 肌营养不良患者、非患病对照及携带者的血浆样本。样本覆盖 4 个不同临床站点。数据集名称中包含 384plex 标识,主题标签为 Proteomics。除上述信息外,关于具体检测了哪些蛋白质、包含多少样本量、数据文件的具体格式与规模等内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,其血浆样本采集自 4 个不同临床站点,涉及 Duchenne 和 Becker 肌营养不良患者、非患病对照及携带者。数据集的英文名称中包含 Scilifelab 与 BIONMD 等标识,并带有 BurcuAyoglu 这一名称信息。关于各临床站点的具体名称、地理位置、样本采集时间、采集流程与伦理审批等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签 Proteomics 以及肌肉骨骼疾病 / 其他的分类,该数据集适用于蛋白质组学相关研究场景,尤其是围绕 Duchenne 和 Becker 肌营养不良的血浆样本分析。由于样本涵盖患者、非患病对照及携带者,并来自 4 个不同临床站点,该数据集可用于涉及上述人群分组的蛋白质组学比较分析。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件组织方式、分析流程或配套工具等信息。

【质量与限制】

源站未提供该数据集在质量评估、数据完整性、批次效应、样本量或技术重复等方面的具体信息。其样本来自 4 个不同临床站点,涉及患者、非患病对照及携带者等多类人群,但关于这些因素对数据质量的影响,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-2564

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

基于抗体悬浮珠阵列的分析方法,对来自4个不同临床中心的杜氏和贝克尔肌营养不良患者、非患病对照组及携带者的血浆样本进行了特征分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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