小鼠骨髓稳态与IL-33诱导嗜酸性粒细胞增多症中嗜酸性粒细胞四个成熟阶段的RNA-seq

该数据集来自ebi.ac.uk,包含小鼠骨髓中嗜酸性粒细胞四个成熟阶段(I至IV)的RNA-seq数据,覆盖稳态与Interleukin-33诱导的嗜酸性粒细胞增多症两种条件

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基因组分类RNA-seq of coding RNAMus musculus
RNA-seq of the 4 stages of maturation of eosinophils in the murine bone marrow in the steady state and in Interleukin-33- induced eosinophilia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

小鼠骨髓稳态与IL-33诱导嗜酸性粒细胞增多症中嗜酸性粒细胞四个成熟阶段的RNA-seq

该数据集为小鼠骨髓嗜酸性粒细胞成熟过程的转录组测序数据,英文名称为“RNA-seq of the 4 stages of maturation of eosinophils in the murine bone marrow in the steady state and in Interleukin-33- induced eosinophilia”。数据覆盖嗜酸性粒细胞成熟的四个阶段(I至IV),并在稳态与Interleukin-33诱导的嗜酸性粒细胞增多症两种生理条件下分别取样,每种条件均设置生物学三重复。样本通过流式细胞术分选获得,测序对象为编码RNA,物种为小鼠(Mus musculus)。该数据集可用于研究两种条件下嗜酸性粒细胞成熟过程中发生的转录变化,来源站点为ebi.ac.uk,在本站归入肌肉骨骼系统疾病/其他分类。

【数据集背景】

嗜酸性粒细胞是来源于骨髓的粒细胞,其成熟过程可分为若干连续阶段。理解这一成熟过程在正常状态与炎症性嗜酸性粒细胞增多状态下的转录调控差异,是免疫学和血液学研究关注的问题。该数据集正是围绕这一背景构建:通过在稳态与Interleukin-33诱导的嗜酸性粒细胞增多症两种条件下,对小鼠骨髓中四个成熟阶段的嗜酸性粒细胞进行转录组测序,为比较两种条件下成熟各阶段的基因表达变化提供数据基础。

【数据内容】

数据内容为编码RNA的RNA-seq数据,来源于小鼠骨髓中嗜酸性粒细胞四个成熟阶段(阶段I至阶段IV)的细胞样本。样本覆盖稳态与Interleukin-33诱导的嗜酸性粒细胞增多症两种条件,每种条件下的各成熟阶段均包含生物学三重复。数据可用于刻画成熟各阶段之间的转录差异,以及两种条件之间同一阶段的表达差异。

【采集与来源】

样本采集自小鼠骨髓,四个成熟阶段的嗜酸性粒细胞通过FACS(荧光激活细胞分选)分选获得,分别在稳态和Interleukin-33诱导的嗜酸性粒细胞增多症条件下进行。数据来源站点为ebi.ac.uk。其余采集细节源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究嗜酸性粒细胞在骨髓中成熟过程的转录组变化,包括四个成熟阶段之间的表达谱比较,以及稳态与Interleukin-33诱导的嗜酸性粒细胞增多症两种条件之间的差异分析。也可作为嗜酸性粒细胞生物学、粒细胞分化及IL-33相关炎症反应研究的参考数据。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

数据设置了生物学三重复,有助于评估组内变异。其余质量控制信息、测序深度、比对与定量流程等源站未提供。使用时应考虑数据仅涉及编码RNA、仅限小鼠骨髓来源细胞,以及仅覆盖稳态与Interleukin-33诱导两种条件这一范围限制。

【引用与许可】

源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-12874

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Christophe Desmet(2024)。稳态及白介素-33诱导的嗜酸性粒细胞增多症中,小鼠骨髓内嗜酸性粒细胞4个成熟阶段的RNA-seq[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-12874

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