检测肌肉活检中抗肌萎缩蛋白表达差异的可重复性:使用MANDYS106抗体和Definiens强度测量(在“对照”显微镜设置下)的免疫荧光法,涵盖从健康对照到BMD和DMD样本的广泛抗肌萎缩蛋白水平

该数据集来自figshare,包含一个Table_3.xls文件,用于评估使用MANDYS106抗体和Definiens强度测量在对照显微镜设置下检测肌肉活检中肌营养不良蛋白表达差异的可重复性

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2023-06-01 更新
浏览 3
医学影像回归trace dystrophin expressionDuchenne Muscular Dystrophy Duchennebiopsyincrease dystrophin levelsdmddystrophin expressionfiber populationcvmembrane intensity parameters
Reproducibility of detecting differences in dystrophin expression in muscle biopsies with a wide range of dystrophin levels from healthy controls to BMD and DMD samples by immunofluorescence using MANDYS106 antibody and Definiens intensity measurements (at ‘control’ microscope settings).

基本信息

模态
医学影像
大小
0.000009728 GB
任务类型
回归
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

检测肌肉活检中抗肌萎缩蛋白表达差异的可重复性:使用MANDYS106抗体和Definiens强度测量(在“对照”显微镜设置下)的免疫荧光法,涵盖从健康对照到BMD和DMD样本的广泛抗肌萎缩蛋白水平

Reproducibility of detecting differences in dystrophin expression in muscle biopsies with a wide range of dystrophin levels from healthy controls to BMD and DMD samples by immunofluorescence using MANDYS106 antibody and Definiens intensity measurements (at ‘control’ microscope settings).

该数据集来自figshare,包含一个Table_3.xls文件,用于评估使用MANDYS106抗体和Definiens强度测量在对照显微镜设置下检测肌肉活检中肌营养不良蛋白表达差异的可重复性。数据覆盖从健康对照到Becker型肌营养不良(BMD)和Duchenne型肌营养不良(DMD)样本的广泛肌营养不良蛋白水平。源站描述涉及批内精密度(CV%)和批间精密度评估,包括基于肌营养不良蛋白强度的样本排序和CV%计算。该数据可用于分析免疫荧光方法的可重复性,支持肌营养不良蛋白表达定量研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《A Sensitive, Reproducible and Objective Immunofluorescence Analysis Method of Dystrophin in Individual Fibers in Samples from Patients with Duchenne Muscular Dystrophy》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0107494。源站首次发布:2014-09-22。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):批内精密度(CV%)是针对同一实验中分析的活检/样本的多个切片的平均肌营养不良蛋白强度计算的。不同天进行的实验之间的批间精密度通过两种方式评估:根据每个实验中的肌营养不良蛋白强度对样本进行排序,以及根据每个实验中的平均肌营养不良蛋白强度计算CV%(实验1和实验2相隔102天进行)。BMD,Becker型肌营养不良;CV,变异系数;DMD,Duchenne型肌营养不良;SD,标准差。使用MANDYS106抗体和Definiens强度测量(在“对照”显微镜设置下)检测从健康对照到BMD和DMD样本的肌肉活检中肌营养不良蛋白表达差异的可重复性。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 9.73 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0107494.t003。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:trace dystrophin expression、Duchenne Muscular Dystrophy Duchenne、biopsy、increase dystrophin levels、dmd、dystrophin expression、fiber population、cv、membrane intensity parameters。本站分类:肌肉骨骼疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Reproducibility_of_detecting_differences_in_dystrophin_expression_in_muscle_biopsies_with_a_wide_range_of_dystrophin_levels_from_healthy_controls_to_BMD_and_DMD_samples_by_immunofluorescence_using_MANDYS106_antibody_and_Definiens_intensity_measurements_a/1177508

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Beekman, Chantal; A. Sipkens, Jessica; Testerink, Janwillem; Giannakopoulos, Stavros; Kreuger, Dyonne; C. van Deutekom, Judith; et al. (2015). Reproducibility of detecting differences in dystrophin expression in muscle biopsies with a wide range of dystrophin levels from healthy controls to BMD and…

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_3.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/1685268"

文件清单

  • Table_3.xls(9.73 KB)

文件总体积 9.73 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

在同一实验中分析的组织活检/样本的多个切片的抗肌萎缩蛋白平均强度用于计算批内精密度(CV%)。不同日期进行的实验之间的批间精密度通过两种方式评估:一是根据各实验中抗肌萎缩蛋白强度对样本进行排序,二是根据各实验中的平均抗肌萎缩蛋白强度计算CV%(实验1和实验2相隔102天进行)。
BMD,贝克型肌营养不良症;CV,变异系数;DMD,杜氏肌营养不良症;SD,标准差。
使用MANDYS106抗体和Definiens强度测量(在“对照”显微镜设置下),通过免疫荧光检测肌肉活检中抗肌萎缩蛋白表达差异的重现性,样本涵盖从健康对照到BMD和DMD样本的广泛抗肌萎缩蛋白水平范围。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0107494.t003(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Reproducibility_of_detecting_differences_in_dystrophin_expression_in_muscle_biopsies_with_a_wide_range_of_dystrophin_levels_from_healthy_controls_to_BMD_and_DMD_samples_by_immunofluorescence_using_MANDYS106_antibody_and_Definiens_intensity_measurements_a/1177508)。

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